- Royal Netherlands Academy of Arts & Sciences (KNAW)
- DANS-KNAW
- Fryske Akademy (FA)
- Hubrecht Institute
- Huygens Instituut
- IISH
- KITLV/Royal Netherlands Institute of Southeast Asian and Caribbean Studies
- KNAW Humanities Cluster
- Meertens Institute
- Netherlands Institute for Neuroscience (NIN)
- NIIN-Heimel Groep: Zicht, Instinct, Angst & Nieuwsgierigheid
- NIN_Salta Groep: Neurogenese & neurodegeneratie, Alzheimer
- NIN_Siclari group
- NIN_Willuhn Groep: Dopamine, compulsief gedrag, motivatie
- NIN-De Zeeuw Groep: Kleine Hersenen coordinatie & Cognitie
- NIN-Dumoulin Groep: Computational Cognitive Neuroscience & Neuroimaging
- NIN-Gazzola Groep: De biologische basis van emoties
- NIN-Huitinga Groep: Neuroimmunologie, Multiple Sclerose
- NIN-Kalsbeek Groep:De biologische klok
- NIN-Kamermans Groep: Zicht & Nystagmus
- NIN-Keysers Groep: Het empathische brein
- NIN-Kole Groep: Elektrische signalen in zenuwuitlopers
- NIN-la Fleur Group: Obesity, diabetes
- NIN-Levelt Groep: Plasticiteit, kritische periodes, visueel systeem, remmende zenuwcellen
- NIN-Lohmann Groep: Spontane breinactiviteit, autisme, ontwikkeling
- NIN-Roelfsema Groep: Visuele perceptie, blindheid en plasticiteit
- NIN-Van Someren Groep: Slaap, slapeloosheid
- NIN-Verhaagen Groep: Neurodegeneratieve ziektes, dwarslaesie, neuroregeneratie, gentherapie
- Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW)
- Netherlands Interdisciplinary Demographic Institute (NIDI)
- NIOD Institute for War, Holocaust and Genocide studies
- Rathenau Institute
- Spinoza Centre for Neuroimaging
- Westerdijk Fungal Biodiversity Institute