NIOO - Microbial Ecology (ME) - Onderzoeksoutput - Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen (KNAW)

2011

Genome sequence of Nitrosomonas sp. AL212, an ammonia-oxidizing bacterium sensitive to high-levels of ammonia

Yuichi, S., Norton, J. M., Bollmann, A., Klotz, M. G., Stein, L. Y., Laanbroek, H. J., Arp, D. J., Goodwin, L. A., Chertkov, O., Held, B., Bruce, D., Detter, J. C., Detter, J. C., Tapia, R. & Han, C. S., 2011, In: Journal of Bacteriology. 193, 18, blz. 5047-5048

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

28 Citaten (Scopus)

118 Downloads (Pure)

Genome sequencing of Nitrosomonas sp. AL212, an ammonia‐oxidizing bacterium adapted for growth at low ammonia concentrations

Norton, J., Suwa, Y., Bollmann, A., Klotz, M. G., Stein, L. Y., Laanbroek, H. J., Arp, D. & Goodwin, L., 2011.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Genomic analysis of bacterial mycophagy

Mela, F., 22 feb. 2011

Onderzoeksoutput: PhD Thesis (Proefschrift) › PhD thesis (Proefschrift)

Open Access

Hydrology is reflected in the functioning and community composition of methanotrophs in the littoral wetland of a boreal lake

Siljanen, H. M. P., Saari, A., Krause, S., Lensu, A., Abell, G. C. J., Bodrossy, L., Bodelier, P. L. E. & Martikainen, P. J., 2011, In: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, blz. 430-445

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

63 Citaten (Scopus)

1 Downloads (Pure)

Idiosyncrasy in ecology - what's in a word?

Hol, W. H. G., Meyer, K. M. & Van der Putten, W. H., 2011, In: Frontiers in Ecology and the Environment. 9, 8, blz. 431-433

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

3 Citaten (Scopus)

177 Downloads (Pure)

Interactions between nitrogenous fertilizers and methane cycling in wetland and upland soils

Bodelier, P. L. E., 2011, In: Current Opinion in Environmental Sustainability. 3, 5, blz. 379-388

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

189 Citaten (Scopus)

2 Downloads (Pure)

Isolation, cultivation, and characterization of ammonia-oxidizing bacteria and archaea adapted to low ammonium concentrations

Bollmann, A., French, A. & Laanbroek, H. J., 2011, In: Methods in Enzymology. 486, blz. 55-88 29 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

71 Citaten (Scopus)

6 Downloads (Pure)

Modelling C and N mineralisation in soil food webs during secondary succession on ex-arable land

Holtkamp, R., Van der Wal, A., Kardol, P., Van der Putten, W. H., de Ruiter, P. C. & Dekker, S. C., 2011, In: Soil Biology & Biochemistry. 43, 2, blz. 251-260

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

102 Citaten (Scopus)

Modelling sugar diffusion across plant leaf cuticles: the effect of free water on substrate availability to phyllosphere bacteria

Van der Wal, A. & Leveau, J. H. J., 2011, In: Environmental Microbiology. 13, 3, blz. 792-797

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

46 Citaten (Scopus)

Natural variation in learning and memory dynamics studied by artificial selection on learning rate in parasitic wasps.

Van den Berg, M., Duivenvoorde, L., Wang, G., Tribuhl, S., Bukovinszky, T., Vet, L. E. M., Dicke, M. & Smid, H. M., 2011, In: Animal Behaviour. 81, 1, blz. 325-333

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

38 Citaten (Scopus)

Nieuw broeikasgaslek ontdekt: ganzenvraat in wetlands en het broeikaseffect

Bodelier, P. L. E. & Bakker, E. S., 2011, In: Mens en Vogel. 49, blz. 32-41

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

Nitrification in inland waters

Laanbroek, H. J. & Bollmann, A., 2011, Nitrification. B. Ward, B., J. Arp, D. & G. Klotz, M. (redactie). American Society for Microbiology, blz. 385-403

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeel › Hoofdstuk › Wetenschappelijk

No apparent costs for facultative antibiotic production by the soil bacterium Pseudomonas fluorescens Pf0-1

Garbeva, P. V., Tyc, O., Remus-Emsermann, M. N. P., Van der Wal, A., Vos, M., Silby, M. W. & De Boer, W., 2011, In: PLoS One. 6, 11, e27266.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

32 Citaten (Scopus)

373 Downloads (Pure)

Nutrient limitation of Avicennia marina near Its northern limit in the Red Sea, Saudi Arabia

Whigham, D. F., Feller, I. C., Batang, Z., Alikunhi, A., Verhoeven, J. T. A., Laanbroek, H. J., Keuskamp, J. A., Hefting, M. M. & Balk, M., 2011.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Phosphatases relieve carbon limitation of microbial activity in Baltic Sea sediments along a redox-gradient

Steenbergh, A. K., Bodelier, P. L. E., Hoogveld, H. L., Slomp, C. P. & Laanbroek, H. J., 2011, In: Limnology and Oceanography. 56, 6, blz. 2018-2026

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

70 Citaten (Scopus)

1 Downloads (Pure)

Quantification of lateral heterogeneity in carbohydrate permeability of isolated plant leaf cuticles

Remus-Emsermann, M. N. P., De Oliveira, S., Schreiber, L. & Leveau, J. H. J., 2011, In: Frontiers in Microbiology. 2, 197.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

38 Citaten (Scopus)

305 Downloads (Pure)

Reciprocal rewards stabilize cooperation in the mycorrhizal symbiosis

Kiers, E. T., Duhamel, M., Beesetty, Y., Mensah, J. A., Franken, O., Verbruggen, E., Fellbaum, C. R., Kowalchuk, G. A., Hart, M. M., Bago, A., Palmer, T. M., West, S. A., Vandenkoornhuyse, P., Jansa, J. & Bücking, H., 2011, In: Science Magazine. 333, 6044, blz. 880-882

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

1377 Citaten (Scopus)

7 Downloads (Pure)

Reversal in competitive dominance of a toxic versus non-toxic cyanobacterium in response to rising CO2

Van de Waal, D. B., Verspagen, J. M. H., Finke, J. F., Vournazou, V., Immers, A., Kardinaal, W. E. A., Tonk, L., Becker, S., Van Donk, E., Visser, P. M. & Huisman, J., 2011, In: ISME Journal. 5, 9, blz. 1438-1450

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

183 Citaten (Scopus)

3 Downloads (Pure)

Seasonal changes in glycerol dialkyl glycerol tetraether concentrations and fluxes in a perialpine lake: Implications for the use of the TEX86 and BIT proxies

Blaga, C. I., Reichart, G. J., Vissers, E. W., Lotter, A. F., Anselmetti, F. S. & Sinninghe Damsté, J. S., 2011, In: Geochimica et Cosmochimica Acta. 75, 21, blz. 6416-6428

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

58 Citaten (Scopus)

1 Downloads (Pure)

Soil and plant factors driving the community of soil-borne microorganisms across chronosequences of secondary succession of chalk grasslands with neutral pH

Kuramae, E. E., Gamper, H. A., Van Veen, J. A. & Kowalchuk, G. A., 2011, In: FEMS Microbiology Ecology. 77, 2, blz. 285-294

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

97 Citaten (Scopus)

2 Downloads (Pure)

Strain-specific incorporation of methanotrophic biomass into eukaryotic grazers in a rice field soil revealed by SIP-PLFA

Murase, J., Hordijk, C. A., Tayasu, I. & Bodelier, P. L. E., 2011, In: FEMS Microbiology Ecology. 75, 2, blz. 284-290

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

19 Citaten (Scopus)

Targeting major soil-borne bacterial lineages using large-insert metagenomic approaches

Kielak, A. M. & Kowalchuk, G. A., 2011, Handbook of Molecular Microbial Ecology II : Metagenomics in Different Habitats. De Bruijn, F. J. (redactie). Wiley-Blackwell, blz. 135-141 Chap 14

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeel › Hoofdstuk › Wetenschappelijk

The genotype dependent presence of pyrrolizidine alkaloids as tertiary amine in Jacobaea vulgaris

Joosten, L., Chenga, D., Mulder, P. P. J., Vrieling, K., Van Veen, J. A. & Klinkhamer, P. G. L., 2011, In: Phytochemistry. 72, 2-3, blz. 214-222

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

25 Citaten (Scopus)

The Metagenomics of Plant Pathogen-Suppressive Soils

Van Elsas, J. D., Kielak, A. M. & Cretoiu, M. S., 2011, Handbook of Molecular Microbial Ecology I: Metagenomics and Complementary Approaches. de Bruijn, FJ. (redactie). Part 4. Chapter 32 redactie Wiley-Blackwell, blz. 277-286

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeel › Hoofdstuk › Wetenschappelijk

2 Citaten (Scopus)

Toward understanding, managing, and protecting microbial ecosystems

Bodelier, P. L. E., 2011, In: Frontiers in Microbiology. 2, 80, blz. 1-8

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

127 Citaten (Scopus)

373 Downloads (Pure)

Transcriptional and antagonistic responses of Pseudomonas fluorescens Pf0-1 to phylogenetically different bacterial competitors

Garbeva, P. V., Silby, M. W., Raaijmakers, J. M., Levy, S. & De Boer, W., 2011, In: ISME Journal. 5, 6, blz. 973-985

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

146 Citaten (Scopus)

4 Downloads (Pure)

2010

(Per)chlorate reduction by an acetogenic bacterium, Sporomusa sp., isolated from an underground gas storage

Balk, M., Mehboob, F., Van Gelder, T., Rijpstra, W. I. C., Sinninghe Damsté, J. S. & Stams, A. J. M., 2010, In: Applied Microbiology and Biotechnology. 88, 2, blz. 595-603

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

44 Citaten (Scopus)

389 Downloads (Pure)

An Individual-Based Approach to Study the Reproductive Success of the Plant Leaf Colonizer Erwinia herbicola Strain 299R

Tecon, R., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

An individual-based approach to surface colonization by bacteria

Tecon, R., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

An individual-based approach to surface colonization by bacteria

Tecon, R., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Bacterial and fungal communities associated with Tuber magnatum productive niches

Mello, A., Miozzi, L., Vizzini, A., Napoli, C., Kowalchuk, G. A. & Bonfante, P., 2010, In: Plant Biosystems. 144, 2, blz. 323-332 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

38 Citaten (Scopus)

5 Downloads (Pure)

Bacteriën ruimen methaan op Doorbraak naar klimaatvriendelijke melkveehouderij

Bodelier, P. L. E., 2010, In: Conceptwijzer Innovatienetwerk.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

Biodegradation and stress in the phyllosphere

Scheublin, T. R. & Leveau, J. H. J., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Biodegradation and stress in the phyllosphere

Scheublin, T. R. & Leveau, J. H. J., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Biphasic kinetics of a methanotrophic community is a combination of growth and increased activity per cell

Steenbergh, A. K., Meima, M., Kamst, M. & Bodelier, P. L. E., 2010, In: FEMS Microbiology Ecology. 71, 1, blz. 12-22

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

75 Citaten (Scopus)

1 Downloads (Pure)

Characteristics and sources of chromophoric dissolved organic matter in lakes of the Yungui Plateau, China, differing in trophic state and altitude

Zhang, Y., Zhang, E., Yin, Y., Van Dijk, M. A., Feng, L., Shi, Z., Liu, M. & Qina, B., 2010, In: Limnology and Oceanography. 55, 6, blz. 2645-2659

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

322 Citaten (Scopus)

Collimonas: Fungus-eating soil bacteria with great potential for discovery of novel antimycotics

Fritsche, K., Van den Berg, M., Mela, F., De Boer, W., Leveau, J. H. J. & Van Veen, J. A., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Comparative analysis of acidobacterial genomic fragments from terrestrial and aquatic metagenomic libraries, with emphasis on acidobacteria subdivision 6

Kielak, A. M., Van Veen, J. A. & Kowalchuk, G. A., 2010, In: Applied and Environmental Microbiology. 76, 20, blz. 6769-6777

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

31 Citaten (Scopus)

273 Downloads (Pure)

Comparing arbuscular mycorrhizal communities of individual plants in a grassland biodiversity experiment

Van de Voorde, T. F. J., Van der Putten, W. H., Gamper, H. A., Hol, W. H. G. & Bezemer, T. M., 2010, In: New Phytologist. 186, 3, blz. 746-754

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

29 Citaten (Scopus)

3 Downloads (Pure)

Comparison of exotic range-expanding and related native plants on plant nutrient acquisition and soil nutrient mineralization

Meisner, A., De Boer, W. & Van der Putten, W. H., 2010, Netherlands Annual Ecology Meeting 2010, Lunteren, The Netherlands, 9 - 10 February, 2010. blz. 38-38

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeel › Bijdrage aan conferentie proceedings › Wetenschappelijk

CREB expression in the brains of two closely related parasitic wasp species that differ in long-term memory formation

Van den Berg, M., Verbaarschot, P., Hontelez, S., Vet, L. E. M., Dicke, M. & Smid, H. M., 2010, In: Insect Molecular Biology. 19, 3, blz. 367-379

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

10 Citaten (Scopus)

Development of a multistrain bacterial bioreporter platform for the monitoring of hydrocarbon contaminants in marine environments

Tecon, R., Beggah, S., Czechowska, K., Sentchilo, V., Chronopoulou, P. M., McGenity, T. J. & van der Meer, J. R., 2010, In: Environmental Science and Technology. 44, 3, blz. 1049-1055

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

61 Citaten (Scopus)

Different effects of exotic range-expanding and relative native plants on microbial-driven soil ecosystem processes

Meisner, A., De Boer, W. & Van der Putten, W. H., 2010, Proceedings of 13th International Symposium on Microbial Ecology, Microbes: stewards of a changing planet, 22-27 August 2010, Seattle, USA. Seattle,USA

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeel › Bijdrage aan conferentie proceedings › Wetenschappelijk

Disentangling drivers of parasitoid foraging behaviour in structured plant communities

Van Waveren, C-S., Meyer, K. M., Wiegand, K. & Bezemer, T. M., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Disruption of root carbon transport into forest humus stimulates fungal opportunists at the expense of mycorrhizal fungi

Lindahl, B. D., De Boer, W. & Finlay, R. D., 2010, In: ISME Journal. 4, 7, blz. 872-881

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

157 Citaten (Scopus)

Downward vascular translocation of a green fluorescent protein-tagged strain of Dickeya sp. (Biovar 3) from stem and leaf inoculation sites on potato

Czajkowski, R. L., de Boer, W. J., Van Veen, J. A. & Van der Wolf, J. M., 2010, In: Phytopathology. 100, 11, blz. 1128-1137

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

33 Citaten (Scopus)

Effectiveness of the application of arbuscular mycorrhiza fungi and organic amendments to improve soil quality and plant performance under stress conditions

Azcón, R. & Medina, A., 2010, In: Journal of Soil Science and Plant Nutrition. 10, 3, blz. 354-372

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

86 Citaten (Scopus)

Effect of phylogenetically unrelated soil bacteria on Pseudomonas fluorescence Pf0-1 behavior and gene expression during competition for nutrients.

Garbeva, P. V., Silby, M. W. & De Boer, W., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

Effect of two types of biosurfactants on phenanthrene availability to the bacterial bioreporter Burkholderia sartisoli strain RP037

Tecon, R. & Van der Meer, J. R., 2010, In: Applied Microbiology and Biotechnology. 85, 4, blz. 1131-1139

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

21 Citaten (Scopus)

1 Downloads (Pure)

EXPLORING MICROBIAL IRON OXIDATION IN WETLAND SOILS

Wang, J., Den Oudsten, F., Meima-Franke, M., Vollrath, S., Muyzer, G., Bodelier, P. L. E. & Laanbroek, H. J., 2010.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan conferentie › Paper › Wetenschappelijk

NIOO - Microbial Ecology (ME)

Onderzoeksoutput

Zoekresultaten