Onderzoeksoutput

Filter
Hoofdstuk
2019

Acidobacteria

Kuramae, E. E. & de Assis Costa, O. Y., 2019, Encyclopedia of Microbiology (Fourth Edition). Schmidt, T. M. (redactie). Oxford: Academic Press, blz. 1-8 8 blz.

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

Methanotroph Ecology, Environmental distribution and functioning.

Bodelier, P. L. E., Pérez, G., Veraart, A. J. & Krause, S., 2019, Methanotrophs: Microbiology Fundamentals and Biotechnological Applications. Lee, E. Y. (redactie). Heidelberg: Springer, (Microbiology Monographs MICROMONO; vol. 32).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)
2018

Laser Ablation Electrospray Ionization-Mass Spectrometry Imaging (LAESI-MS) for Spatially Resolved Plant Metabolomics

Etalo, D. W., Díez-Simón, C., De Vos, R. C. H. & Hall, R. D., 15 mei 2018, Plant Metabolomics . Humana Press, blz. 253-267 (Methods in Molecular Biology; vol. 1778).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)
2017

Microbial Ecosystem Functions in Wetlands Under Disturbance

Steenbergh, A. K., Veraart, A. J., Ho, A. & Bodelier, P. L. E., 2017, Microbial Biomass: A Paradigm Shift in Terrestrial Biochemistry. Tate, K. (redactie). World Scientific

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

4 Downloads (Pure)

Protocols for the Identification of Phyllosphere-Induced Pollutant Degradation Genes

Scheublin, T. R., 2017, Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols: Field Studies. McGenity, T. J., Timmis, K. N. & Nogales, B. (redactie). Berlin, Heidelberg: Springer Verlag GmbH, blz. 229-235 7 blz. ( Springer Protocols Handbooks).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

2016

Calling in the Dark: the Role of Volatiles for Communication in the Rhizosphere

van Dam, N. M., Weinhold, A. & Garbeva, P. V., 2016, Deciphering Chemical language of Plant Communication. Springer, blz. 175-210 (Signaling and Communication in Plants).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

7 Downloads (Pure)

De weerbare bodem

De Boer, W., 2016, Leve(n)de bodem: de basis onder ons bestaan. Brussaard, L., Govers, F. & Buiter, R. (redactie). Stichting Biowetenschappen en Maatschappij, Vol. 3. blz. 36-42 (Cahiers Biowetenschappen en Maatschappij).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukPopulair

Open Access
Bestand
52 Downloads (Pure)
2015

Impact of land-use changes in the Amazon on bacterial diversity, composition and distribution

Mendes, L. W., Navarrete, A. A., Borges, C. D., Kuramae, E. E. & Tsai, S. M., 2015, Land-use Change Impacts on Soil Process: Tropical and Savannah Ecosystems. Brearley, F. Q. & Thomas, A. D. (redactie). Chapter 5 redactie Wallingford, UK: CABI Publisher, blz. 41-54

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

The minimal rhizosphere microbiome

Raaijmakers, J., 2015, Principles of Plant-Microbe Interactions. Lugtenberg, B. (redactie). Springer, blz. 411-419 (Microbes for sustainable agriculture).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2014

Beneficial interactions in the rhizosphere

Hol, W. H. G., De Boer, W. & Medina, A., 2014, Interactions in soil: promoting plant growth. Dighton, J. & Krumins, J. A. K. (redactie). Springer, Vol. Vol 1. blz. 59-80 (Biodiversity, Community and Ecosystems).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Extraction Methods, Variability Encountered in

Bodelier, P. L. E., 2014, Encyclopedia of Metagenomics. Nelson, K. E. (redactie). Heidelberg: Springer, 9 blz.

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

4 Downloads (Pure)

Interactions between methane and nitrogen cycling; current metagenomics studies and future trends

Bodelier, P. L. E. & Steenbergh, A. K., 2014, Metagenomics of the Microbial Nitrogen Cycle. Marco, D. (redactie). Caister Academic Press

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

5 Downloads (Pure)

Microbial Ecosystems, Protection of

Bodelier, P. L. E., 2014, Encyclopedia of Metagenomics. Nelson, K. E. (redactie). Heidelberg: Springer, 9 blz.

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)
2013

Bacterial Colonization of the Arbuscular Mycorrhizal Fungal Hyphosphere

Scheublin, T. R., 2013, Molecular Microbial Ecology of The Rhizosphere. de Bruijn, F. J. (redactie). Wiley-Blackwell, blz. 525-534 49 blz. Chap 49

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Rhizosphere Responses to Elevated CO2

Drigo, B. & Kowalchuk, G. A., 2013, Molecular Microbial Ecology of The Rhizosphere. de Bruijn, F. J. (redactie). Wiley-Blackwell, blz. 1063-1074 Chap 100

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Stimulation of Rhizosphere Microbial Communities During Chemophytostabilization of a Pb–Zn Mine Soil

Galenda, M. A., Epelde, L., Gomez-Sagasti, M. T., Barrutia, J. M., Hernandez, A., Becerril, J. M., Kowalchuk, G. A. & Garbiscu, C., 2013, Molecular Microbial Ecology of The Rhizosphere. de Bruijn, F. J. (redactie). Wiley-Blackwell, blz. 1013-1022 Chap 95

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

13 Downloads (Pure)
2012

Microbiële diversiteit

Van Veen, H., 2012, Biodiversiteit. van den Broek, J., Eijsackers, H., van Straalen, N. & Evenblij, M. (redactie). Stichting Biowetenschappen en Maatschappij, Vol. kwartaal 4. blz. 26-27 (Cahier Bio-Wetenschappen en Maatschappij).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukProfessioneel

2011

Ecogenomica. Sleutel tot een verborgen wereld

Van Veen, J. A., 2011, Microcanon. Wat je beslist moet weten over microbiologie. Diemen: Veen Media, blz. 51-53 Chap 14

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukPopulair

Nitrification in inland waters

Laanbroek, H. J. & Bollmann, A., 2011, Nitrification. B. Ward, B., J. Arp, D. & G. Klotz, M. (redactie). American Society for Microbiology, blz. 385-403

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

Targeting major soil-borne bacterial lineages using large-insert metagenomic approaches

Kielak, A. M. & Kowalchuk, G. A., 2011, Handbook of Molecular Microbial Ecology II : Metagenomics in Different Habitats. De Bruijn, F. J. (redactie). Wiley-Blackwell, blz. 135-141 Chap 14

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

The Metagenomics of Plant Pathogen-Suppressive Soils

Van Elsas, J. D., Kielak, A. M. & Cretoiu, M. S., 2011, Handbook of Molecular Microbial Ecology I: Metagenomics and Complementary Approaches. de Bruijn, FJ. (redactie). Part 4. Chapter 32 redactie Wiley-Blackwell, blz. 277-286

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2008

Interactions between saprotrophic basidiomycetes and bacteria

De Boer, W. & Van der Wal, A., 2008, British Mycological Society Symposia Series, Volume 28. Boddy, L., Frankland, J. C. & van West, P. (redactie). Amsterdam: Elsevier B.V., blz. 141-151

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

Microbial diversity underground: do we need to protect the Earth's greatest source of biodiversity?

Kowalchuk, G. A., 2008, Forgotten kingdoms : proceedings of a seminar on the conservation of small and hidden species at the occasion of the retirement of Wim Bergmans as scientific director of IUCN NL. Bergmans, W., de Iongh, H. & Simons, H. (redactie). Amsterdam [etc.]: IUCN National Committee of the Netherlands [etc.], blz. 17-29

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)
2007

Biocontrol of plant pathogens: Principles, promises and pitfalls

Lugtenberg, B. & Leveau, J. H. J., 2007, The Rhizosphere: Biochemistry and Organic Substances at the Soil-Plant Interface. Pinton, R., Varanini, Z. & Nannipieri, P. (redactie). Boca Raton, Fla: CRC Press, Inc., blz. 267-296

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

6 Downloads (Pure)

Methodological approaches to the study of carbon flow and the associated microbial population dynamics in the rhizosphere

Van Veen, J. A., Morgan, J. A. W. & Whipps, J. M., 2007, The Rhizosphere: Biochemistry and Organic Substances at the Soil-Plant Interface. Pinton, R., Varanini, Z. & Nannipieri, P. (redactie). Boca Raton, Fla: CRC Press, Inc., blz. 371-399

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2 Downloads (Pure)

Reporter gene systems useful in evaluating in situ gene expression by soil- and plant-associated bacteria

Leveau, J. H. J., Loper, J. E. & Lindow, S. E., 2007, Manual of Environmental Microbiology, 3rd edition. Hurst, C. J., Crawford, R. L., Garland, J. L., Lipson, D. A., Mills, A. L. & Stetzenbach, L. D. (redactie). Washington, D.C.: American Society for Microbiology, blz. 734-747

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2 Downloads (Pure)

Valid recovery of nucleic acid sequence information from high contamination risk samples – Ancient DNA and environmental DNA

Kowalchuk, G. A., Austin, J. J., Gooding, P. S. & Stephen, J. R., 2007, New High Throughput Technologies for DNA Sequencing and Genomics. Mitchelson, K. R. (redactie). Amsterdam: Elsevier B.V., blz. 357-371

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2006

Assessing bacterial and fungal community structure in soil using ribosomal RNA and other structural gene markers

Kowalchuk, G. A., Drigo, B., Yergeau, E. & Van Veen, J. A., 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Nannipieri, P. & Smalla, K. (redactie). Heidelberg: Springer, blz. 159-188

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

21 Downloads (Pure)

Biodiversity in European shallow lakes: a multilevel-multifactorial field study

De Meester, L., Declerck, S., Janse, J. H., Dagevos, J. J., Portielje, R., Lammens, E., Jeppesen, E., Lauridsen, T., Schwenk, K., Muylaert, K., van der Gucht, K., Vyverman, W., Zwart, G., van Hannen, E., van Puijenbroek, P., Conde-Porcuna, J-M., Sanchez-Castillo, P., Vandekerkhove, J. & Brendonck, L., 2006, Wetlands: Functioning, Biodiversity Conservation, and Restoration. Bobbink, R., Beltman, B., Verhoeven, J. T. A. & Whigham, D. F. (redactie). Berlin: Springer Verlag GmbH, Vol. 191. blz. 149-167 (Ecological Studies-Analysis and Synthesis).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijkpeer review

Concepts and methods to assess the phytosanitary quality of soils

Alabouvette, C., Raaijmaker, J., De Boer, W., Notz, R., Défago, G., Steinberg, C. & Lemanceau, P., 2006, Microbiological Methods for Assessing Soil Quality. Bloem, J. (redactie). CAB International, blz. 257-269

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

Ecological Aspects of Microbes and Microbial Communities Inhabiting the Rhizosphere of Wetland Plants

Bodelier, P. L. E., Frenzel, P., Drake, H., Hurek, T., Küsel, K., Lovell, C., Megonigal, P., Reinhold-Hurek, B. & Sorrell, B., 2006, Wetlands and Natural Resource Management. Verhoeven, J. T. A., Beltman, B., Bobbink, R. & Whigman, D. F. (redactie). Berlin; Heidelberg: Springer, blz. 205-238 (Ecological Studies).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)

Microbial communities in the phyllosphere

Leveau, J. H. J., 2006, Biology of the Plant Cuticle. Riederer, M. & Müller, C. (redactie). Oxford: Blackwell, blz. 334-367

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2005

Central issues for aquatic food webs: from chemical cues to whole system responses

Scharler, U. M., Hulot, F. D., Baird, D. J., Cross, W. F., Culp, J., Layman, C. A., Raffaelli, D., Vos, M. & Winemiller, K. O., 2005, Dynamic Food Webs: Multispecies Assemblages, Ecosystem Development and Environmental Change. C. de Ruiter, P., Wolters, V. R. & C. Moore, J. (redactie). Amsterdam: Elsevier B.V., blz. 451-462

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

Inducible defenses in food webs

Vos, M., Kooi, B. W., DeAngelis, D. L. & Mooij, W. M., 2005, Dynamic Food Webs: Multispecies Assemblages, Ecosystem Development, and Environmental Change. C. De Ruiter, P., Wolters, V. & C. Moore, J. (redactie). Amsterdam: Elsevier B.V., blz. 114-127

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Life Cycle of Glomus Species in Monoxenic Culture

Dalpé, Y., De Souza, F. A. & Declerck, S., 2005, In Vitro Culture of Mycorrhizas. Declerck, S., Strullu, D-G. & Fortin, A. (redactie). Berlin: Springer, blz. 49-71 (Soil Biology Vol. 4).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

Life History Strategies in Gigasporaceae: insight from monoxenic culture

De Souza, F. A., Dalpé, Y., Declerck, S., De la Providencia, I. E. & Séjalon-Delmas, N., 2005, In Vitro Culture of Mycorrhizas. Declerck, S., Strullu, D-G. & Fortin, A. (redactie). Berlin: Springer, blz. 73-91 (Soil Biology Vol. 4).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Molecular detection of fungal communities in soil

Smit, E., De Souza, F. A. & Landeweert, R., 2005, Molecular Microbial Ecology. Osborn, A. M. & Smith, C. J. (redactie). New York: Taylor & Francis Group, blz. 303-316

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Nutrient limitation of freshwater cyanobacteria

Dignum, H., Matthijs, H. C. P., Pel, R., Laanbroek, H. J. & Mur, L. R., 2005, Harmful Cyanobacteria. Huisman, J., Matthijs, H. C. P. & Visser, P. M. (redactie). Dordrecht: Springer, blz. 65-86 (Aquatic Ecology Series Vol. 3).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Optical detection of cyanobacterial blooms

Gons, H. J., Hakvoort, H., Peters, S. W. M. & Simis, S. G. H., 2005, Harmful Cyanobacteria. Huisman, J., Matthijs, H. C. P. & Visser, P. M. (redactie). Dordrecht: Springer, blz. 177-199 (Aquatic Ecology Series Vol. 3).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

9 Downloads (Pure)

The rhizosphere-historical and future perspectives from a microbiologist's viewpoint

Van Veen, J. A., 2005, Rhizosphere 2004-Perspectives and challenges : A Tribute to Lorenz Hiltner. Hartmann, A. (redactie). Neuherberg: GSF - Forschungszentrum für Umwelt und Gesundheit, blz. 29-34

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)
2004

Community Analysis using PCR- Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

Kowalchuk, G. A. & Smit, E., 2004, Molecular Microbial Ecology Manual, 2nd edition. Kowalchuk, G. A., de Bruijn, F. J., Head, I. M., Akkermans, A. D. L. & van Elsas, J. D. (redactie). Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, blz. 771-788 Chap 3.14

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Detection of bacterial lactone quorum sensing signals

Rice, S. A., Kjelleberg, S., Givskog, M., De Boer, W. & Chernin, L. S., 2004, Molecular Microbial Ecology Manual, 2nd edition. Kowalchuk, G. A., de Bruijn, F. J., Head, I. M., Akkermans, A. D. L. & van Elsas, J. D. (redactie). Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, blz. 1629-1649 Chap 8.04

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Leaf surface sugars

Leveau, J. H. J., 2004, Encyclopeadia of Plant and Crop Science. Goodman, R. M. (redactie). New York: Marcel Dekker, blz. 642-645

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)
2003

Interactions between oxygen-releasing roots and microbial processes in flooded soils and sediments

Bodelier, P. L. E., 2003, Root Ecology. De Kroon, H. & Visser, E. J. W. (redactie). Berlin, Heidelberg: Springer, blz. 331-362 (Ecological Studies).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)
2002

Ribotyping methods for assessment of in situ microbial community structure

Stephen, J. R. & Kowalchuk, G. A., 2002, Encyclopedia of Environmental Microbiology. Bitton, G. (redactie). New York: John Wiley and Sons Ltd, blz. 2728-2741

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2001

A combined phospholipid and 16S rDNA PCR-DGGE analysis to study bioremediative communities in situ

MacNaughton, S. J., Stephen, J. R., Chang, Y. J., Davis, G. A., Kowalchuk, G. A., Gan, Y-D., Brüggemann, J. & White, D. C., 2001, Molecular Environmental Microbiology: Protocols and Applications. Rochelle, P. (redactie). Horizon Scientific Press, blz. 141-160

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1 Downloads (Pure)

Are chitinolytic rhizosphere bacteria really beneficial to plants?

De Boer, W. & Van Veen, J. A., 2001, Biotic Interactions in Plant-Pathogen Associations. Jeger, M. J. & Spence, N. J. (redactie). Wallingford: CAB International, blz. 121-130

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)
2000

Nitrogen: recent developments in related microbial processes

Van Veen, J. A., 2000, Biological Resource Management, Connecting Science and Policy. Balazs, E. (redactie). Berlin: Springer, blz. 71-80

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

1999

Fungal community analysis using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)

Kowalchuk, G. A., 1999, Molecular Microbial Ecology Manual 3.4.6:. D. L. Akkermans, A., D. Van Elsas, J. & De Bruijn, F. J. (redactie). Dordrecht, the Netherlands: Kluwer Academic Publishers, blz. 1-16

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukWetenschappelijk

2 Downloads (Pure)