Onderzoeksoutput

Filter
Artikel
2020

Airborne medicine - Bacterial volatiles and their influence on plant health: Transley review

Garbeva, P. & Weisskopf, L., 2020, In : New Phytologist. 226, 1, blz. 32-43

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
39 Downloads (Pure)

A non-invasive soil based setup to study tomato root volatiles released by healthy and infected roots

Gulati, S., Ballhausen, M-B., Kulkarni, P., Grosch, R. & Garbeva, P., 2020, In : Scientific Reports. 10, 12704.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
19 Downloads (Pure)

Babassu palm (Attalea speciosa Mart.) super-dominance shapes its surroundings via multiple biotic, soil chemical, and physical interactions and accumulates soil carbon: a case study in eastern Amazonia

Gehring, C., Zelarayán, M. C., Luz, R. L., Almeida, R. B., Boddey, R. M. & Leite, M. F. A., 2020, In : Plant and Soil.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Bacterial consortium and microbial metabolites increase grain quality and soybean yield

Moretti, L. G., Cruciol, C. A. C., Bossolani, J. W., Momesso, L., Garcia, A., Kuramae, E. & Hungria, M., 2020, In : Journal of Soil Science and Plant Nutrition. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Bacterial Tomato Pathogen Ralstonia solanacearum Invasion Modulates Rhizosphere Compounds and Facilitates the Cascade Effect of Fungal Pathogen Fusarium solani

Su, L., Zhang, L., Qiu, P., Nie, D., Kuramae, E., Shen, B. & Shen, Q., 2020, In : Microorganisms. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Can flooding-induced greenhouse gas emissions be mitigated by trait-based plant species choice?

Orama, N. J., van Groeningen, J. W., Bodelier, P., Brenzinger, K., Cornelissen, J. H. C., De Deyn, G. & Abalos, D., 2020, In : Science of the Total Environment. 727, 20 July, 138476.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
28 Downloads (Pure)

Can Palisade and Guinea Grass Sowing Time in Intercropping Systems Affect Soybean Yield and Soil Chemical Properties?

Costa, N., Andreotti, M., Costa Crusciol, C. A., Magelhaes Pariz, C., Bossolani, J. W., de Castilhos, A. M., Costa do Nascimento, C. A., da Rocha Lima, C. G., dos Santos Batista Bonini, C. & Kuramae, E., 2020, In : Frontiers In Sustainable Food Systems. 4, 81.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
55 Downloads (Pure)

Consecutive lactate formation and chain elongation to reduce exogenous chemicals input in repeated-batch food waste fermentation

Contreras-Dávila, C. A., Carrión, V. J., Vonk, V. R., Buisman, C. N. J. & Strik, D. P. B. T. B., 2020, In : Water Research. 169, 115215.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
198 Downloads (Pure)

Co-occurrence patterns among prokaryotes across an age gradient in pit mud of Chinese strong-flavor liquor

Zheng, Y., Hu, X., Jia, Z., Bodelier, P., Guo, Z., Zhang, Y., Li, F., Li, X. & He, P., 2020, In : Canadian Journal of Microbiology. Online

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
67 Downloads (Pure)

Cultivation-independent and cultivation-dependent metagenomes reveal genetic and enzymatic potential of microbial community involved in the degradation of a complex microbial polymer

Costa, O. Y. A., De Hollander, M., Pijl, A., Liu, B. & Kuramae, E., 2020, In : Microbiome. in press, 76.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
39 Downloads (Pure)

Decomposition of mixtures of cover crop residues increases microbial functional diversity

Drost, S. M., Rutgers, M., Wouterse, M., De Boer, W. & Bodelier, P., 2020, In : Geoderma. 361, 114060.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

DiSCount: computer vision for automated quantification of Striga seed germination

Masteling, R., Voorhoeve, L., Ijsselmuiden, J., Dini-Andreote, F., De Boer, W. & Raaijmakers, J. M., 01 mei 2020, In : Plant Methods. 16, 60

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
32 Downloads (Pure)

DNA stable-isotope probing highlights the effects of temperature on functionally active methanotrophs in natural wetlands

Zhang, L., Dumont, M. G., Bodelier, P. L. E., Adams, J. M., He, D. & Chu, H., 2020, In : Soil Biology & Biochemistry. 149

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Draft Genome Sequence of Lipopeptide-Producing Strain Pseudomonas fluorescens DSM 11579 and Comparative Genomics with Pseudomonas sp. Strain SH-C52, a Closely Related Lipopeptide-Producing Strain

Kirchner, N., Cano-Prieto, C., van der Voort, M., Raaijmakers, J. M. & Gross, H., 2020, In : MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS. 9

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
31 Downloads (Pure)

Dynamics and resilience of soil mycobiome under multiple organic and inorganic pulse disturbances

Lourenço, K. S., Suleiman, A. K. A., Pijl, A., Cantarella, H. & Kuramae, E., 2020, In : Science of the Total Environment. 733, 1 september, 139173.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
101 Downloads (Pure)

Dynamics of active potential bacterial and fungal interactions in the assimilation of acidobacterial EPS in soil

Costa, O. Y. A., Pijl, A. & Kuramae, E., 2020, In : Soil Biology & Biochemistry. 148

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
20 Downloads (Pure)

Ecology and genomics of Actinobacteria: new concepts for natural product discovery

van Bergeijk, D. A., Terlouw, B. R., Medema, M. H. & van Wezel, G. P., 2020, In : Nature Reviews Microbiology.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Effect of donor-recipient relatedness on the plasmid conjugation frequency: a meta-analysis

Alderliesten, J. B., Duxbury, S. J. N., Zwart, M. P., de Visser, J. A. G. M., Stegeman, A. & Fischer, E. A. J., 2020, In : BMC Microbiology. 20, 1

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
25 Downloads (Pure)

Effect of nitrogen on fungal growth efficiency

Di Lonardo, D. P., van der Wal, A., Harkes, P. & de Boer, W., 2020, In : Plant Biosystems.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
50 Downloads (Pure)

Effects of growth-promoting bacteria on soybean root activity, plant development and yield

Moretti, L. G., Crusciol, C. A. C., Kuramae, E., Bossolani, J. W., Moreira, A., Costa, N. R., Alves, C. J., Pascoaloto, I. M., Rondina, A. B. L. & Hungria, M., 2020, In : Agronomy Journal. 112, 1, blz. 418-428

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Effects of plastic mulch film residues on wheat rhizosphere and soil properties

Qi, Y., Ossowicki, A., Yang, X., Huerta Lwanga, E., Dini-Andreote, F., Geissen, V. & Garbeva, P., 2020, In : Journal of Hazardous Materials. 387, 121711.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
205 Downloads (Pure)

From toilet to agriculture: Fertilization with microalgal biomass from wastewater impacts the soil and rhizosphere active microbiomes, greenhouse gas emissions and plant growth

Suleiman, A. K. A., Lourenço, K. S., Clark, C., Luz, R. L., Silva, G. H. R., Vet, L. E. M., Cantarella, H., Fernandes, T. V. & Kuramae, E., 2020, In : Resources, Conservation and Recycling. 161

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
15 Downloads (Pure)

Fungal volatiles influence plant defence against aboveground and belowground herbivory

Moisan, K., Aragón, M., Gort, G., Dicke, M., Cordovez, V., Raaijmakers, J. M. & Lucas-Barbosa, D., 2020, In : Functional Ecology. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Grand challenges in Terrestrial Microbiology: moving on from a decade of progress in microbial biogeochemistry: SPECIALTY GRAND CHALLENGE ARTICLE

Bodelier, P. & Hallin, S., 2020, In : Frontiers in Microbiology. 11, 981.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
15 Downloads (Pure)

Impact of different trace elements on the growth and proteome of two strains of Granulicella, class “Acidobacteriia”

Costa, O. Y. A., Oguejiofor, C., Zuehlke, D., Barreto, C. C., Wünsche, C., Riedel, K. & Kuramae, E., 2020, In : Frontiers in Microbiology. 11

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
15 Downloads (Pure)

Impact of hydraulic retention time on community assembly and function of photogranules for wastewater treatment

Trebuch, L. M., Oyserman, B. O., Janssen, M., Wijffels, R. H., Vet, L. E. M. & Fernandes, T. V., 2020, In : Water Research. 173, 115506.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Investigating the effect of belowground microbial volatiles on plant nutrient status: perspective and limitations

Martín-Sánchez, L., Ariotti, C., Garbeva, P. & Vigani, G., 2020, In : Journal of Plant Interactions. 15, 1, blz. 188-195

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
30 Downloads (Pure)

Lecanicillium gracile (Cordycipitaceae), a new species isolated from mineral building materials

Ponizovskaya, V. B., Grum-Grzimaylo, A. A., Georgieva, M. L., Kokaeva, L. Y. & Bilanenko, E. N., 2020, In : Phytotaxa.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Long-term lime and gypsum amendment increase nitrogen fixation and decrease nitrification and denitrification gene abundances in the rhizosphere and soil in a tropical no-till intercropping system

Bossolani, J. W., Crusciol, C. A. C., Merloti, L. F., Moretti, L. G., Costa, N., Tsai, S. M. & Kuramae, E., 2020, In : Geoderma. 375

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
42 Downloads (Pure)

Microbial and volatile profiling of soils suppressive to Fusarium culmorum of wheat

Ossowicki, A., Tracanna, V., Petrus, M. L. C., van Wezel, G., Raaijmakers, J. M., Medema, M. H. & Garbeva, P., 2020, In : Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences. 287, 1921, 20192527.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

Microbial functional diversity in vineyard soils: sulfur metabolism and links with grapevine plants and wine quality

Mocali, S., Kuramae, E., Kowalchuk, G., Fornasier, F. & Priori, S., 2020, In : Frontiers in Environmental Science. 8

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
16 Downloads (Pure)

Microbial N‑cycling genes abundance are affected by cover crop specie and development stage in an integrated cropping system

Rocha, K. F., Kuramae, E., Borges, B. M. F., Leite, M. F. A. & Rosolem, C. A., 2020, In : Archives of Microbiology.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Multitrophic interactions in the rhizosphere microbiome of wheat: from bacteria and fungi to protists

Rossmann, M., Pérez-Jaramillo, J. E., Kavamura, V. N., Chiaramonte, J. B., Dumack, K., Fiore-Donno, A. M., Mendes, L. W., Ferreira, M. M. C., Bonkowski, M., Raaijmakers, J. M., Mauchline, T. H. & Mendes, R., 2020, In : FEMS Microbiology Ecology. 96, 4, fiaa032.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Niche Differentiation of Host-associated Pelagic Microbes and Their Potential Contribution to Biogeochemical Cycling in Artificially Warmed Lakes

Samad, M. S., Lee, H. J., Cerbin, S., Meima-Franke, M. & Bodelier, P., 2020, In : Frontiers in Microbiology. 11

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

No evidence of modulation of indirect plant resistance of Brassica rapa plants by volatiles from soil-borne fungi

Moisan, K., Lucas-Barbosa, D., Villela, A., Greenberg, L. O., Cordovez, V., Raaijmakers, J. M. & Dicke, M., 2020, In : Ecological Entomology. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
29 Downloads (Pure)

Plant functional group drives the community structure of saprophytic fungi in a grassland biodiversity experiment

Francioli, D., van Rijssel, S. Q., van Ruijven, J., Termorshuizen, A. J., Cotton, T. E. A., Dumbrell, A. J., Raaijmakers, J. M., Weigelt, A. & Mommer, L., 2020, In : Plant and Soil. Online

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
64 Downloads (Pure)

Production of glycine-derived ammonia as a low-cost and long-distance antibiotic strategy by Streptomyces

Avalos, M., Garbeva, P., Raaijmakers, J. M. & van Wezel, G. P., 2020, In : ISME Journal. 14, blz. 568-583

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Bestand
82 Downloads (Pure)

Responses of Acidobacteria Granulicella sp. WH15 to high carbon revealed by integrated omics analyses

Costa, O. Y. A., Zerillo, M., Zühlke, D., Kielak, A. M., Pijl, A., Riedel, K. & Kuramae, E., 2020, In : Microorganisms. 8, 2, 244.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
59 Downloads (Pure)

Six Multiplex TaqManTM-qPCR Assays for Quantitative Diagnostics of Pseudomonas Species Causative of Bacterial Blotch Diseases of Mushrooms

Taparia, T., Krijger, M., Hodgetts, J., Hendriks, M., Elphinstone, J. G. & van der Wolf, J., 2020, In : Frontiers in Microbiology. 11, blz. 989 1 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
32 Downloads (Pure)

Sorghum Growth Promotion by Paraburkholderia tropica and Herbaspirillum frisingense: Putative Mechanisms Revealed by Genomics and Metagenomics

Kuramae, E., Derksen, S., Schlemper, T., Dimitrov, M., Costa, O. Y. A. & da Silveira, A. P. D., 2020, In : Microorganisms. 8, 5, E725.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
30 Downloads (Pure)

Structure and ecological function of the soil microbiome affecting plant-soil feedbacks in the presence of a soil-borne pathogen

Hannula, E., Ma, H., Perez Jaramillo, J. E., Pineda, A. M. & Bezemer, T. M., 2020, In : Environmental Microbiology. 22, 2, blz. 660-676

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
115 Downloads (Pure)

Tannins from senescent Rhizophora mangle mangrove leaves have a different effect on prokaryotic and eukaryotic communities in a Distichlis spicata salt marsh soil

Zhang, Q. & Laanbroek, H. J., 2020, In : FEMS Microbiology Ecology. 96, 9

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

The ecological role of bacterial seed endophytes associated with wild cabbage in the United Kingdom

Tyc, O., Putra, R., Gols, R., Harvey, J. A. & Garbeva, P., 2020, In : MicrobiologyOpen. 9, 1, e00954.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
124 Downloads (Pure)

The hidden potential of saprotrophic fungi in arable soil: patterns of short-term stimulation by organic amendments

Clocchiatti, A., Hannula, E., Van den Berg, M., Korthals, G. & De Boer, W., 2020, In : Applied Soil Ecology. 147, 103434.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
98 Downloads (Pure)

The modulation of sugarcane growth and nutritional profile under aluminum

Godoy Labanca, E. R., Andrade, S. A. L., Kuramae, E. & da Silveira, A. P. D., 2020, In : Applied Soil Ecology. 156, 103715.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Upland rice yield enhanced by early nitrogen fertilization on previous palisade grass

Momesso, L., Crusciol, C. A. C., Soratto, R. P., Tanaka, K. S., Costa, C. H. M., Cantarella, H. & Kuramae, E., 2020, In : Nutrient Cycling in Agroecosystems. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Bestand
19 Downloads (Pure)

Volatile-mediated antagonism of soil bacterial communities against fungi

Li, X. G., Garbeva, P., Liu, X., Klein Gunnewiek, P. J. A., Clocchiatti, A., Hundscheid, M. P. J., Wang, X. & De Boer, W., 2020, In : Environmental Microbiology. 22, 3, blz. 1025-1035

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
70 Downloads (Pure)
2019

A Physiological and Genomic Comparison of Nitrosomonas Cluster 6a and 7 Ammonia-Oxidizing Bacteria

Sedlacek, C. J., McGowan, B., Suwa, Y., Sayavedra-Soto, L., Laanbroek, H. J., Stein, L. Y., Norton, J. M., Klotz, M. G. & Bollmann, A., nov 2019, In : Microbial Ecology. 78, 4, blz. 985-994

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Assessing nickel tolerance of bacteria isolated from serpentine soils

Silva Costa, F., Figueiredo Sena Macedo, M. W., Araujo, A., Rodrigues, C., Kuramae, E. E., Alcanfor, S., Pessoa-Filho, M. & Barreto, C. C., 2019, In : Brazilian Journal of Microbiology. 50, 3, blz. 705-713

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Bacterial Community Assembly in a Typical Estuarine Marsh with Multiple Environmental Gradients

Yao, Z., Du, S., Liang, C., Zhao, Y., Dini-Andreote, F., Wang, K. & Zhang, D., mrt 2019, In : Applied and Environmental Microbiology. 85, 6, e02602.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review