Onderzoeksoutput

Filter
Artikel
2020

Volatile-mediated antagonism of soil bacterial communities against fungi

Li, X. G., Garbeva, P., Liu, X., Klein Gunnewiek, P. J. A., Clocchiatti, A., Hundscheid, M. P. J., Wang, X. & De Boer, W., 2020, In : Environmental Microbiology. 22, 3, blz. 1025-1035

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
88 Downloads (Pure)

Volatiles from soil-borne fungi affect directional growth of roots

Moisan, K., Raaijmakers, J. M., Dicke, M., Lucas-Barbosa, D. & Cordovez, V., 2020, In : Plant, Cell and Environment. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Volatiles from the fungus Fusarium oxysporum affect interactions of Brassica rapa plants with root herbivores

Moisan, K., Dicke, M., Raaijmakers, J. M., Rachmawati, E. & Cordovez, V., 2020, In : Ecological Entomology. in press

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Bestand
14 Downloads (Pure)
2019

A Physiological and Genomic Comparison of Nitrosomonas Cluster 6a and 7 Ammonia-Oxidizing Bacteria

Sedlacek, C. J., McGowan, B., Suwa, Y., Sayavedra-Soto, L., Laanbroek, H. J., Stein, L. Y., Norton, J. M., Klotz, M. G. & Bollmann, A., nov 2019, In : Microbial Ecology. 78, 4, blz. 985-994

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Assessing nickel tolerance of bacteria isolated from serpentine soils

Silva Costa, F., Figueiredo Sena Macedo, M. W., Araujo, A., Rodrigues, C., Kuramae, E. E., Alcanfor, S., Pessoa-Filho, M. & Barreto, C. C., 2019, In : Brazilian Journal of Microbiology. 50, 3, blz. 705-713

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Bacterial Community Assembly in a Typical Estuarine Marsh with Multiple Environmental Gradients

Yao, Z., Du, S., Liang, C., Zhao, Y., Dini-Andreote, F., Wang, K. & Zhang, D., mrt 2019, In : Applied and Environmental Microbiology. 85, 6, e02602.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Bacterial community composition and diversity of two different forms of an organic residue of bioenergy crop

Cipriano, M., Suleiman, A. K. A., da Silveira, A. P. D., Carmo, J. B. & Kuramae, E. E., 2019, In : PeerJ. 7, e6768.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
221 Downloads (Pure)

Biological activities associated with the volatile compound 2,5-bis(1-methylethyl)-pyrazine

Janssens, T. K. S., Tyc, O., Besselink, H., De Boer, W. & Garbeva, P. V., 2019, In : FEMS Microbiology Letters. fnz023.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
153 Downloads (Pure)

Conventional & organic soil management as divergent drivers of resident and active fractions of major soil food web constituents

Harkes, P., Suleiman, A. K. A., van den Elsen, S., De Haan, J., Holterman, M., Kuramae, E. & Helder, J., 2019, In : Scientific Reports. 9, 13521 (2019).

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
50 Downloads (Pure)

Deciphering rhizosphere microbiome assembly of wild and modern common bean (Phaseolus vulgaris) in native and agricultural soils from Colombia

Perez Jaramillo, J. E., De Hollander, M., Ramirez, C. A., Mendes, R., Raaijmakers, J. M. & Carrión, V. J., 2019, In : Microbiome. 7, 114.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
116 Downloads (Pure)

Ecology and Evolution of Plant Microbiomes

Cordovez, V., Dini-Andreote, F., Carrión, V. J. & Raaijmakers, J. M., 2019, In : Annual Review of Microbiology. Online

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Editorial: special issue on the ecology of soil microorganisms

Pennanen, T., Fritze, H., de Boer, W. & Baldrian, P., dec 2019, In : FEMS Microbiology Ecology. 95, 12, fiz154.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
80 Downloads (Pure)

Effect of the amount of organic trigger compounds, nitrogen and soil microbial biomass on the magnitude of priming of soil organic matter

Di Lonardo, P., De Boer, W., Zweers, A. J. & Van der Wal, A., 2019, In : PLoS One. 15, 5, 0216730.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
85 Downloads (Pure)

Environmental filtering: A case of bacterial community assembly in soil

Yan, Y., Klinkhamer, P. G. L., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2019, In : Soil Biology & Biochemistry. 136, 107531.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Ethyl tert-butyl ether (EtBE) degradation by an algal-bacterial culture obtained from contaminated groundwater

van der Waals, M., Plugge, C. M., Meima-Franke, M., de Waard, P., Bodelier, P. L. E., Smidt, H. & Gerritse, J., 2019, In : Water Research. 148, January, blz. 314-323

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Exploitation of new endophytic bacteria and their ability to promote sugarcane growth and nitrogen nutrition

da Silveira, A. P. D., Iório, R. D. P. F. I., Marcos, F. C. C., Fernandes, A. O., De Souza, S. A. C. D., Kuramae, E. E. & Cipriano, M., 2019, In : Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology. 112, 2, blz. 283-295

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Extracting the GEMs: Genotype, Environment and Microbiome interactions shaping host phenotypes

Oyserman, B. O., Cordovez, V., Sarango Flores, S. W., Nijveen, H., Medema, M. H. & Raaijmakers, J. M., 2019, In : bioRxiv. Preprint

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijk

Open Access
Bestand
55 Downloads (Pure)

Fungal-bacterial diversity and microbiome complexity predict ecosystem functioning

Wagg, C., Schlaeppi, K., Banerjee, S., Kuramae, E. & Van der Heijden, M. G. A., 2019, In : Nature Communications. 10, 4841.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
188 Downloads (Pure)

Harnessing the microbiome to control plant parasitic weeds

Masteling, R., Lombard, L., De Boer, W., Raaijmakers, J. M. & Dini-Andreote, F., 2019, In : Current Opinion in Microbiology. 49, June, blz. 26-33

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
95 Downloads (Pure)

High-level abundance of Methanobacteriales and Syntrophobacterales may help to prevent corrosion of metal sheet piles

in 't Zandt, M. H., Kip, N., Frank, J., Jansen, S., van Veen, J. A., Jetten, M. S. M. & Welte, C. U., 2019, In : Applied and Environmental Microbiology. 85, 20, AEM.01369-19.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Identification of loci associated with enhanced virulence in Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus isolates using a deep sequencing approach

Zwart, M., Ali, G., van Strien, E. A., Schijlen, E. G. W. M., van der Werf, W., Vlak, J. M. & Wang, M., 2019, In : Viruses. 11, 9, 872.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
43 Downloads (Pure)

Impacts of long-term plant residue management on soil organic matter quality, Pseudomonas community structure and disease suppressiveness

Dignam, B. E. A., O'Callaghan, M., Condron, L. M., Raaijmakers, J. M., Kowalchuk, G. A. & Wakelin, S. A., 2019, In : Soil Biology & Biochemistry. online, blz. 396-406

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Impacts of Nitrogen Management on No-Till Maize Production Following Forage Cover Crops

Momesso, L., Crusciol, C. A. C., Soratto, R. P., Vyn, T. J., Tanaka, K. S., Costa, C. H. M., Neto, J. F. & Cantarella, H., 2019, In : Agronomy Journal. 111, 2, blz. 639-649

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Latitudinal variation in soil nematode communities under climate warming-related range-expanding and native plants

Wilschut, R. A., Geisen, S., Martens, H. J., Kostenko, O., De Hollander, M., Ten Hooven, F. C., Weser, C., Snoek, B., Bloem, J., Caković, D., Čelik, T., Koorem, K., Krigas, N., Manrubia, M., Ramirez, K. S. R., Tsiafouli, M. A., Vreš, B. & van der Putten, W. H., 2019, In : Global Change Biology. 25, 8, blz. 2714-2726

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
99 Downloads (Pure)

Legacy of land use history determines reprogramming of plant physiology by soil microbiome

Li, X. G., Jousset, A., De Boer, W., Carriön, V. J., Zhang, T., Wang, X. & Kuramae, E. E., 2019, In : ISME Journal. 13, blz. 738-751

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
461 Downloads (Pure)

Linking ecology and plant pathology to unravel the importance of soil-borne fungal pathogens in species-rich grasslands

Ampt, E. A., van Ruijven, J., Raaijmakers, J. M., Termorshuizen, A. J. & Mommer, L., 2019, In : European Journal of Plant Pathology. 154, 1, blz. 141-156

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
84 Downloads (Pure)

Long-term farming systems modulate multi-trophic responses

Lupatini, M., Korthals, G. W., Roesch, L. F. W. & Kuramae, E. E., 2019, In : Science of the Total Environment. 646, blz. 480-490

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
273 Downloads (Pure)

Marine probiotics: increasing coral resistance to bleaching through microbiome manipulation

Rosado, P. M., Leite, D. C. A., Duarte, G. A. S., Chaloub, R. M., Jospin, G., Nunes da Rocha, U., P. Saraiva, J., Dini-Andreote, F., Eisen, J. A., Bourne, D. G. & Peixoto, R. S., 2019, In : ISME Journal. 13, 4, blz. 921-936 16 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
149 Downloads (Pure)

Methylotetracoccus oryzae Strain C50C1 Is a Novel Type Ib Gammaproteobacterial Methanotroph Adapted to Freshwater Environments

Ghashghavi, M., Belova, S., Bodelier, P. L. E., Dedysh, S., Kox, M. A. R., Speth, D., Frenzel, P., Jetten, M., Lücker, S. & Lüke, C., 2019, In : mSphere. 4, e00631-18.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
85 Downloads (Pure)

Microbe-driven chemical ecology – past, present and future

Schmidt, R. L., Ulanova, D., Wick, L. Y., Bode, H. B. & Garbeva, P. V., 2019, In : ISME Journal. 13, blz. 2656-2663

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
175 Downloads (Pure)

Moisture is more important than Temperature for Assembly of Both Potentially Active and Whole Prokaryotic Communities in Subtropical Grassland

Lupatini, M., Suleiman, A. K. A., Jacques, R. J. S., Pylro, V. S., van Veen, J. A., Kuramae, E. E. & Roesch, L. F. W., 2019, In : Microbial Ecology. 77, 2, blz. 460-470

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Nitrification inhibitors effectively target N2O-producing Nitrosospira spp. in tropical soil

Cassman, N., Soares, J. R., Pijl, A. S., Lourenço, K. S., van Veen, J. A., Cantarella, H. & Kuramae, E. E., 2019, In : Environmental Microbiology. 21, 4, blz. 1241-1254

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
351 Downloads (Pure)

On the stability of sequences inserted into viral genomes

Willemsen, A. & Zwart, M. P., 2019, In : Virus Evolution. 5, 2, vez045.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
147 Downloads (Pure)

Organic amendment strengthens interkingdom associations in the soil and rhizosphere of barley (Hordeum vulgare)

Suleiman, A. K. A., Harkes, P., van den Elsen, S., Holterman, M., Korthals, G. W., Helder, J. & Kuramae, E. E., 2019, In : Science of the Total Environment. 133885.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Pathogen-induced activation of disease-suppressive functions in the endophytic root microbiome

Carrión, V. J., Perez Jaramillo, J. E., Cordovez, V., Tracanna, V., De Hollander, M., Ruiz Buck, D., Mendes, L. W., van IJcken, W. F. J., Gómez Expósito, R., Elsayed, S. S., Mohanraju, P., Arifah, A., van der Oost, J., Paulson, J. N., Mendes, R., van Wezel, G., Medema, M. H. & Raaijmakers, J. M., 2019, In : Science. 366, 6465, blz. 606-612

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Pathogen suppression by microbial volatile organic compounds in soils

De Boer, W., Li, X. G., Meisner, A. & Garbeva, P. V., 2019, In : FEMS Microbiology Ecology. 95, 8, fiz105.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

4 Downloads (Pure)

Peat substrate amended with chitin modulates the N-cycle, siderophore and chitinase responses in the lettuce rhizobiome

de Tender, C., Mesuere, B., van der Jeugt, F., Haegeman, A., Ruttink, T., Vandecasteele, B., Dawyndt, P., Debode, J. & Kuramae, E. E., 09 jul 2019, In : Scientific Reports. 9

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
144 Downloads (Pure)

Phosphate fertilization on nutritional status and growth of upland rice cultivars

Crusciol, C. A. C., Momesso, L. & Nascimento, C. A. C., 09 aug 2019, In : Journal of Plant Nutrition. 42, 13, blz. 1516-1528 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Phylogenomic analyses and distribution of terpene synthases among Streptomyces

Martín-Sánchez, L., Saurabh Singh, K., Avalos Garcia, M., van Wezel, G. P., Dickschat, J. S. & Garbeva, P. V., 2019, In : Beilstein Journal of Organic Chemistry. 15, blz. 1181–1193

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
160 Downloads (Pure)

Plant presence reduces root and shoot litter decomposition rates of crops and wild relatives

Barel, J. M., Kuyper, T. W., de Boer, W. & De Deyn, G. B., 2019, In : Plant and Soil. 438, 1, blz. 313-327 15 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
51 Downloads (Pure)

Polyphasic classification of the gifted natural product producer Streptomyces roseifaciens sp. nov.

van der Aart, L. T., Nouioui, I., Kloosterman, A., Igual, J-M., Willemse, J., Goodfellow, M. & van Wezel, G. P., 2019, In : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 69, 4, blz. 899-908 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Resistance breeding of common bean shapes the physiology of the rhizosphere microbiome

Mendes, L. W., Gonçalves De Chaves, M., da Fonseca, M. D. C., Mendes, R., Raaijmakers, J. M. & Tsai, S. M., 2019, In : Frontiers in Microbiology. 10, 2019.02252.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
65 Downloads (Pure)

Resolving broad patterns of prokaryotic community structure in New Zealand pasture soils

Kaminsky, R. A., Wakelin, S. A., Highton, M. P., Samad, M. S. & Morales, S. E., 17 okt 2019, In : New Zealand Journal of Agricultural Research. Online, blz. 1-19 19 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Rice straw serves as additional carbon source for rhizosphere microorganisms and reduces root exudate consumption

Maarastawi, S. A., Frindte, K., Bodelier, P. L. E. & Knief, C., 2019, In : Soil Biology & Biochemistry. 135, August, blz. 235-238

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Root-associated microbiomes of wheat under the combined effect of plant development and nitrogen fertilization

Chen, S., Waghmode, T. R., Sun, R., Kuramae, E., Hu, C. & Liu, B., 2019, In : Microbiome. 7, 136(2019).

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
121 Downloads (Pure)

Root traits and belowground herbivores relate to plant-soil feedback variation among congeners

Wilschut, R. A., van der Putten, W. H., Garbeva, P. V., Harkes, P., Konings, W., Kulkarni, P., Martens, H. J. & Geisen, S., 2019, In : Nature Communications. 10, 1564(2019).

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
162 Downloads (Pure)

Saturated N2O emission rates occur above the nitrogen deposition level predicted for the semi-arid grasslands of Inner Mongolia, China

Gu, X., Wang, Y., Laanbroek, H. J., Xu, X., Song, B., Huo, Y., Chen, S., Li, L. & Zhang, L., 2019, In : Geoderma. 341, blz. 18-25 8 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Strategies to mitigate the nitrous oxide emissions from nitrogen fertilizer applied with organic fertilizers in sugarcane

Lourenço, K. S., Rossetto, R., Vitti, A. C., Montezano, Z. F., Soares, J. R., Sousa, R. M., Carmo, J. B., Kuramae, E. E. & Cantarella, H., 2019, In : Science of the Total Environment. 650, Part I, blz. 1476-1486

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Striga, Sorghum en micro-organismen: De jonge gewasbeschermer

Masteling, R., mrt 2019, In : Gewasbescherming. 86, blz. 52

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelPopulair

Open Access
Bestand
8 Downloads (Pure)

Towards restoring urban waters: understanding the main pressures

Teurlincx, S., Kuiper, J. J., Hoevenaar, E. C. M., Lurling, M., Brederveld, R. J., Veraart, A. J., Janssen, A. B. G., Mooij, W. M. & Domis, L. N. D. S., feb 2019, In : Current Opinion in Environmental Sustainability. 36, blz. 49-58

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review