Onderzoeksoutput

Filter
Artikel
2012

A 3-year study reveals that plant growth stage, season and field site affect soil fungal communities while cultivar and GM-trait have minor effects

Hannula, S. E., De Boer, W. & Van Veen, J. A., 2012, In : PLoS One. 7, 4, e33819.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
320 Downloads (Pure)

Acidicapsa borealis gen. nov., sp. nov. and Acidicapsa ligni sp. nov., subdivision 1 Acidobacteria from Sphagnum peat and decaying wood

Kulichevskaya, I. S., Kostina, L. A., Valášková, V., Rijpstra, I. C., Sinninghe Damsté, J. S., De Boer, W. & Dedysh, S. N., 2012, In : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62, PT_7, blz. 1512-1520

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijk

3 Downloads (Pure)

A comparison of rpoB and 16S rRNA as markers in pyrosequencing studies of bacterial diversity

Vos, M., Quince, C., Pijl, A. S., De Hollander, M. & Kowalchuk, G. A., 2012, In : PLoS One. 7, 2, e30600.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
340 Downloads (Pure)

Animal Bone Char Solubilization with Itaconic Acid Produced by Free and Immobilized Aspergillus terreus Grown on Glycerol-Based Medium

Vassilev, N., Medina, A., Eichler-Lobermann, B., Flor-Peregrin, E. & Vassileva, M., 2012, In : Applied Biochemistry and Biotechnology. 168, 5, blz. 1311-1318

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

4 Downloads (Pure)

Archaeal dominated ammonia-oxidizing communities in Icelandic grassland soils are moderately affected by long-term N fertilization and geothermal heating

Daebeler, A., Abell, G. C. J., Bodelier, P. L. E., Bodrossy, L., Frampton, D. M., Hefting, M. M. & Laanbroek, H. J., 2012, In : Frontiers in Microbiology. 3, 14 blz., 00352.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
383 Downloads (Pure)

Bacterial diversity and geochemical profiles in sediments from eutrophic Azorean lakes

da Costa Martins, G., Henriques, I., Ribeiro, D. C., Correia, A., Bodelier, P. L. E., Cruz, J. V., Brito, A. G. & Nogueira, R., 2012, In : Geomicrobiology Journal. 29, 8, blz. 704-715

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Bad News for Soil Carbon Sequestration?

Kowalchuk, G. A., 2012, In : Science Magazine. 337, 6098, blz. 1049-1050

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Characterization of bacterial isolates from rotting potato tuber tissue showing antagonism to Dickeya sp. biovar 3 in vitro and in planta

Czajkowski, R. L., De Boer, W. J., Van Veen, J. A. & Van der Wolf, J. M., 2012, In : Plant Pathology. 61, 1, blz. 169-182

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
4 Downloads (Pure)

Characterization of Methylobacterium strains isolated from the phyllosphere and description of Methylobacterium longum sp nov

Knief, C., Dengler, V., Bodelier, P. L. E. & Vorholt, J. A., 2012, In : Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology. 101, 1, blz. 169-183

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

5 Downloads (Pure)

Community assembly, species richness and nestedness of arbuscular mycorrhizal fungi in agricultural soils

Verbruggen, E., Van der Heijden, M. G. A., Kowalchuk, G. A. & Röling, W. F. M., 2012, In : Molecular Ecology. 21, 10, blz. 2341-2353

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Community patterns of soil bacteria and nematodes in relation to geographic distance

Monroy, F., Van der Putten, W. H., Yergeau, E., Mortimer, S. R., Duyts, H. & Bezemer, T. M., 2012, In : Soil Biology & Biochemistry. 45, blz. 1-7

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

6 Downloads (Pure)

Comparative genomics of bacteria from the genus Collimonas: linking (dis)similarities in gene content to phenotypic variation and conservation

Mela, F., Fritsche, K., De Boer, W., Van den Berg, M., Van Veen, J. A., Maharaj, N. N. & Leveau, J. H. J., 2012, In : Environmental Microbiology Reports. 4, 4, blz. 424-432

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Controls on Coarse Wood Decay in Temperate Tree Species: Birth of the LOGLIFE Experiment

Cornelissen, J. H. C., Sass-Klaassen, U., Poorter, L., Van Geffen, K. G., Van Logtestijn, R., Van Hal, J., Goudzwaard, L., Sterck, F. J., Klaassen, R. K. W. M., Freschet, G. T., Van der Wal, A., Eshuis, H., Zuo, J., De Boer, W., Lamers, T., Weemstra, M., Cretin, V., Martin, R., Den Ouden, J., Berg, M. P. & 3 anderen, Aerts, R., Mohren, G. M. J. & Hefting, M. M., 2012, In : Ambio. 41, blz. 231-245

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

Draft Genome Sequence of the Antagonistic Rhizosphere Bacterium Serratia plymuthica Strain PRI-2C

Garbeva, P. V., Van Elsas, J. D. & De Boer, W., 2012, In : Journal of Bacteriology. 194, 15, blz. 4119-4120

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
382 Downloads (Pure)

Draft Genome Sequence of the Biocontrol Strain Serratia plymuthica A30, Isolated from Rotting Potato Tuber Tissue

Czajkowski, R. L. & Van der Wolf, J. M., 2012, In : Journal of Bacteriology. 194, 24, blz. 6999-7000

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
345 Downloads (Pure)

Effect van veranderingen in klimaat en ruimtedruk op de microbiologische zwemwaterkwaliteit

Van der Wal, A., Van Velzen, E. & Kardinaal, E., 2012, In : H2O. 45, 16, blz. 25-27

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelProfessioneel

General Surveillance of the soil ecosystem: An approach to monitoring unexpected adverse effects of GMO's

Smit, E., Bakker, P. A. H. M., Bergmans, H., Bloem, J., Griffiths, B. S., Rutgers, M., Sanvido, O., Singh, B. K., Van Veen, J. A., Wilhelm, R. & Glandorf, D. C. M., 2012, In : Ecological Indicators. 14, 1, blz. 107-113

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Links between pseudometallophytes and rhizosphere microbial communities in a metalliferous soil

Epelde, L., Becerril, J. M., Blanco, F., Kowalchuk, G. A. & Garbisu, C., 2012, In : Pedobiologia. 55, 4, blz. 219-225

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

Matgrass sward plant species benefit from soil organisms

Brinkman, E. P., Raaijmakers, C. E., Bakx-Schotman, J. M. T., Hannula, S. E., Kemmers, R. H., De Boer, W. & Van der Putten, W. H., 2012, In : Applied Soil Ecology. 62, blz. 61-70

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Methane source strength and energy flow shape methanotrophic communities in oxygen-methane counter-gradients

Krause, S., Lüke, C. & Frenzel, P., 2012, In : Environmental Microbiology Reports. 4, 2, blz. 203-208

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Microbiology of the phyllosphere: a playground for testing ecological concepts

Meyer, K. M. & Leveau, J. H. J., 2012, In : Oecologia. 168, 3, blz. 621-629

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

One millimetre makes the difference: high-resolution analysis of methane-oxidizing bacteria and their specific activity at the oxic–anoxic interface in a flooded paddy soil

Reim, A., Lüke, C., Krause, S., Prachter, J. & Frenzel, P., 2012, In : ISME Journal. 6, 11, blz. 2128-2139

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

On-line detection of root-induced volatiles in Brassica nigra plants infested with Delia radicum L. root fly larvae

Crespo, E., Hordijk, C. A., de Graaf, R., Samudrala, D., Cristescu, S. M., Harren, F. J. M. & Van Dam, N. M., 2012, In : Phytochemistry. 84, blz. 68-77

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Quantitative and specific detection of the biocontrol agent, Serratia plymuthica, in plant extracts using a real-time TaqMan(A (R)) assay

Czajkowski, R. L. & Van der Wolf, J. M., 2012, In : Journal of Applied Genetics. 53, 4, blz. 457-467

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Reciprocal effects of litter from exotic and congeneric native plant species via soil nutrients

Meisner, A., De Boer, W., Cornelissen, J. H. C. & Van der Putten, W. H., 2012, In : PLoS One. 7, 2, e31596.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
355 Downloads (Pure)

Shifts in soil microorganisms in response to warming are consistent across a range of Antarctic environments

Yergeau, E., Bokhorst, S. F., Kang, S., Zhou, J., Greer, C. W., Aerts, R. & Kowalchuk, G. A., 2012, In : ISME Journal. 6, 3, blz. 692-702

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

Singulisphaera rosea sp. nov., a planctomycete from acidic Sphagnum peat, and emended description of the genus Singulisphaera

Kulichevskaya, I. S., Detkova, E. N., Bodelier, P. L. E., Rijpstra, W. I. C., Sinninghe Damsté, J. S. & Dedysh, S. N., 2012, In : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62, 1, blz. 118-123

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Soil characteristics more strongly influence soil bacterial communities than land-use type

Kuramae, E. E., Yergeau, E., Wong, L., Pijl, A. S., Van Veen, J. A. & Kowalchuk, G. A., 2012, In : FEMS Microbiology Ecology. 79, 1, blz. 12-24

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

5 Downloads (Pure)

Spatial patterns of iron- and methane-oxidizing bacterial communities in an irregularly flooded, riparian wetland

Wang, J., Krause, S., Muyzer, G., Meima-Franke, M., Laanbroek, H. J. & Bodelier, P. L. E., 2012, In : Frontiers in Microbiology. 3, 64.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
393 Downloads (Pure)

Structural and functional response of methane-consuming microbial communities to different flooding regimes in riparian soils

Bodelier, P. L. E., Bär-Gilissen, M. J., Meima-Franke, M. & Hordijk, C. A., 2012, In : Ecology and Evolution. 2, 1, blz. 106-127

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
337 Downloads (Pure)

Studies on the interaction between the biocontrol agent, Serratia plymuthica A30, and blackleg-causing Dickeya sp (biovar 3) in potato (Solanum tuberosum)

Czajkowski, R. L., De Boer, W. J., Van Veen, J. A. & Van der Wolf, J. M., 2012, In : Plant Pathology. 61, 4, blz. 677-688

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Summer warming accelerates sub-arctic peatland nitrogen cycling without changing enzyme pools or microbial community structure

Weedon, J. T., Kowalchuk, G. A., Aerts, R., Van Hal, J., Van Logtestijn, R., Tas, N., Roling, W. F. M. & Van Bodegom, P. M., 2012, In : Global Change Biology. 18, 1, blz. 138-150

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

Testing Potential Effects of Maize Expressing the Bacillus thuringiensis Cry1Ab Endotoxin (Bt Maize) on Mycorrhizal Fungal Communities via DNA- and RNA-Based Pyrosequencing and Molecular Fingerprinting

Verbruggen, E., Kuramae, E. E., Hillekens, R. H. E., De Hollander, M., Kiers, E. T., Roling, W. F. M., Kowalchuk, G. A. & Van der Heijden, M. G. A., 2012, In : Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, blz. 7384-7392

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
302 Downloads (Pure)

Testing the paradox of enrichment along a land use gradient in a multitrophic aboveground and belowground community

Meyer, K. M., Vos, M., Mooij, W. M., Hol, W. H. G., Termorshuizen, A. J. & Van der Putten, W. H., 2012, In : PLoS One. 7, 11, e49034.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
350 Downloads (Pure)

The capacity to comigrate with Lyophyllum sp strain Karsten through different soils is spread among several phylogenetic groups within the genus Burkholderia

Nazir, R., Zhang, M. Z., De Boer, W. & Van Elsas, J. D., 2012, In : Soil Biology & Biochemistry. 50, blz. 221-233

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

The distribution of ammonia-oxidizing betaproteobacteria in stands of Black mangroves (Avicennia germinans)

Laanbroek, H. J., Keijzer, R. M., Verhoeven, J. T. A. & Whigham, D. F., 2012, In : Frontiers in Microbiology. 3, 153

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
432 Downloads (Pure)

The importance of fungi in the potato rhizosphere

Hannula, S. E., 2012, In : Gewasbescherming. 43, 4, blz. 127-128

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelProfessioneel

Open Access
Bestand
67 Downloads (Pure)

The mechanics of bacterial cluster formation on plant leaf surfaces as revealed by bioreporter technology

Tecon, R. & Leveau, J. H. J., 2012, In : Environmental Microbiology. 14, 5, blz. 1325-1332

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Une nouvelle levure pathogene decouverte en Europe

Huet, J., 2012, In : Bulletins-electroniques.com. blz. 41

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelPopulair

Unlocking the potential of metagenomics through replicated experimental design

Knight, R., Jansson, J., Field, D., Fierer, N., Desai, N., Fuhrman, J. A., Hugenholtz, P., Van der Lelie, D., Meyer, F., Stevens, R., Bailey, M. J., Gordon, J. I., Kowalchuk, G. A. & Gilbert, J. A., 2012, In : Nature Biotechnology. 30, 6, blz. 513-520

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Variation in local carrying capacity and the individual fate of bacterial colonizers in the phyllosphere

Remus-Emsermann, M. N. P., Tecon, R., Kowalchuk, G. A. & Leveau, J. H. J., 2012, In : ISME Journal. 6, 4, blz. 756-765

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Virus infection decreases the attractiveness of white clover plants for a non-vectoring herbivore

Van Molken, T., De Caluwe, H., Hordijk, C. A., Leon-Reyes, A., Snoeren, T. A. L., Van Dam, N. M. & Stuefer, J. F., 2012, In : Oecologia. 170, 2, blz. 433-444

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
309 Downloads (Pure)
2011

Acetate utilization as a survival strategy of peat-inhabiting Methylocystis spp

Belova, S. E., Baani, M., Suzina, N. E., Bodelier, P. L. E., Liesack, W. & Dedysh, S. N., 2011, In : Environmental Microbiology Reports. 3, 1, blz. 36-46

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2 Downloads (Pure)

An EST-based analysis identifies new genes and reveals distinctive gene expression features of Coffea arabica and Coffea canephora

Mondego, J. M. C., Vidal, R. O., Carazzolle, M. F., Tokuda, E. K., Parizzi, L. P., Costa, G. G. L., Pereira, L. F. P., Andrade, A. C., Colombo, C. A., Vieira, L. G. E., Pereira, G. A. G. & Kuramae, E. E., 2011, In : BMC Plant Biology. 11, blz. 30

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
288 Downloads (Pure)

Aquatic herbivores facilitate the emission of methane from wetlands

Dingemans, B. J. J., Bakker, E. S. & Bodelier, P. L. E., 2011, In : Ecology. 92, 5, blz. 1166-1173

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
393 Downloads (Pure)

A species concept for bacteria based on adaptive divergence

Vos, M., 2011, In : Trends in Microbiology. 19, 1, blz. 1-7

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Comparison of nutrient acquisition in exotic plant species and congeneric natives

Meisner, A., De Boer, W., Verhoeven, K. J. F., Boschker, H. T. S. & Van der Putten, W. H., 2011, In : Journal of Ecology. 99, 6, blz. 1308-1315

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
1 Downloads (Pure)

Control of blackleg and tuber soft rot of potato caused by Pectobacterium and Dickeya species: a review

Czajkowski, R. L., Pérombelon, M. C. M., Van Veen, J. A. & Van der Wolf, J. M., 2011, In : Plant Pathology. 60, 6, blz. 999-1013

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2 Downloads (Pure)

Defensive properties of pyrrolizidine alkaloids against microorganisms

Joosten, L. & Van Veen, J. A., 2011, In : Phytochemistry Reviews. 10, 1, blz. 127-136

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
309 Downloads (Pure)

Differences in volatile profiles of turnip plants subjected to single and dual herbivory above- and belowground

Pierre, P. S., Jansen, J. J., Hordijk, C. A., Van Dam, N. M., Cortesero, A. M. & Dugravot, S., 2011, In : Journal of Chemical Ecology. 37, 4, blz. 368-377

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
336 Downloads (Pure)