Elli Bleeker koos na een bachelor Franse taal en cultuur (2009) aan de Universiteit van Amsterdam voor een master Book and Digital Media Studies (2010) aan de Universiteit Leiden. Deze master was een schot in de roos en bracht haar op het spoor van de digitale editiewetenschap en bronontsluiting. Na drie jaar als junior researcher bij het Huygens ING te hebben gewerkt aan het project Manuscripten Anne Frank (2011-2014), begon ze aan haar promotieonderzoek bij het Centre for Manuscript Genetics aan de Universiteit Antwerpen (2014-2017). Daarin onderzocht ze de veranderende rol van de wetenschappelijke digitale editeur van moderne manuscripten. Ze kreeg hiervoor een beurs van het Marie Sklodowska-Curie Training Network DiXiT en werd getraind in het bestuderen en editeren van manuscripten en het modelleren van tekst in TEI/XML. Daarna keerde ze terug naar Nederland om te werken bij het R&D team van de afdeling Digitale Infrastrutuur (2017-2020). Momenteel werkt ze als onderzoeker bij DHLab van het KNAW Humanities Cluster. Daarnaast is ze associate editor van het tijdschrift Variants, board member van de European Society of Textual Scholarship en de DH Benelux Steering Committee, en lid van de Maatschappij der Nederlandse Letterkunde.