Hans Clevers

Onderzoeksoutput

Onderzoeksoutput per jaar 1985 2009 2010 2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020 2021 2023 2023

• 772 Artikel
• 16 Boek/film/artikelrecensie
• 2 Boek
• 1 Hoofdstuk
• 1 Meer
  • 1 Patent

Onderzoeksoutput per jaar

Onderzoeksoutput per jaar

Zoekresultaten

• 2023

  A living biobank of matched pairs of patient-derived xenografts and organoids for cancer pharmacology

  Xu, X., Kumari, R., Zhou, J., Chen, J., Mao, B., Wang, J., Zheng, M., Tu, X., An, X., Chen, X., Zhang, L., Tian, X., Wang, H., Dong, X., Bao, Z., Guo, S., Ouyang, X., Shang, L., Wang, F., Yan, X., & 4 anderenZhang, R., Vries, R. G. J., Clevers, H. & Li, Q-X., 2023, In: PLoS ONE. 18, 1, blz. e0279821

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Heterografts 68%
  • Pharmacology 50%
  • Neoplasms 24%
  • Investigational Therapies 15%
  5 Citaten (Scopus)

• A tissue-intrinsic IL-33/EGF circuit promotes epithelial regeneration after intestinal injury

  Calafiore, M., Fu, Y-Y., Vinci, P., Arnhold, V., Chang, W. Y., Jansen, S. A., Egorova, A., Takashima, S., Kuttiyara, J., Ito, T., Serody, J., Nakae, S., Turnquist, H., van Es, J., Clevers, H., Lindemans, C. A., Blazar, B. R. & Hanash, A. M., 05 sep. 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 5411

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • interleukins 100%
  • stem cells 82%
  • Interleukin-33 81%
  • regeneration 66%
  • Epidermal Growth Factor 58%
  4 Citaten (Scopus)

• Atypical teratoid/rhabdoid tumoroids reveal subgroup-specific drug vulnerabilities

  Paassen, I., Williams, J., Ríos Arceo, C., Ringnalda, F., Mercer, K. S., Buhl, J. L., Moreno, N., Federico, A., Franke, N. E., Kranendonk, M., Upadhyaya, S. A., Kerl, K., van de Wetering, M., Clevers, H., Kool, M., Hoving, E. W., Roussel, M. F. & Drost, J., mei 2023, In: Oncogene. 42, 20, blz. 1661-1671 11 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Typical Teratoid Rhabdoid Tumor 100%
  • Atypical Teratoid Tumor 99%
  • Pharmaceutical Preparations 25%
  • Brain Neoplasms 9%
  • Epigenomics 9%
  6 Citaten (Scopus)

• Ceramides Increase Fatty Acid Utilization in Intestinal Progenitors to Enhance Stemness and Increase Tumor Risk

  Li, Y., Chaurasia, B., Rahman, M. M., Kaddai, V., Maschek, J. A., Berg, J. A., Wilkerson, J. L., Mahmassani, Z. S., Cox, J., Wei, P., Meikle, P. J., Atkinson, D., Wang, L., Poss, A. M., Playdon, M. C., Tippetts, T. S., Mousa, E. M., Nittayaboon, K., Anandh Babu, P. V., Drummond, M. J., & 7 anderenClevers, H., Shayman, J. A., Hirabayashi, Y., Holland, W. L., Rutter, J., Edgar, B. A. & Summers, S. A., nov. 2023, In: Gastroenterology. 165, 5, blz. 1136-1150 15 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Sphingolipids 100%
  • Ceramides 96%
  • Fatty Acids 69%
  • Serine C-Palmitoyltransferase 59%
  • Stem Cells 34%
  11 Citaten (Scopus)

• Development of Plasmodium falciparum liver-stages in hepatocytes derived from human fetal liver organoid cultures

  Yang, A. S. P., Dutta, D., Kretzschmar, K., Hendriks, D., Puschhof, J., Hu, H., Boonekamp, K. E., van Waardenburg, Y., Chuva de Sousa Lopes, S. M., van Gemert, G-J., de Wilt, J. H. W., Bousema, T., Clevers, H. & Sauerwein, R. W., 02 aug. 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 4631

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • RNA Sequencing 100%
  • parasites 86%
  • Organoids 79%
  • liver 66%
  • Plasmodium falciparum 63%
  3 Citaten (Scopus)

• Directed Differentiation of Murine and Human Small Intestinal Organoids Toward All Mature Lineages

  Martinez-Silgado, A., Beumer, J. & Clevers, H., 2023, In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2650, blz. 107-122 16 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Organoids 100%
  • Adult Stem Cells 22%
  2 Citaten (Scopus)

• DNA damage triggers squamous metaplasia in human lung and mammary cells via mitotic checkpoints

  Juan, L. S., Freije, A., Sanz-Gómez, N., Jiménez-Matías, B., Pleguezuelos-Manzano, C., Sanz, J. R., de Diego, E., Naranjo, S., Clevers, H. & Gandarillas, A., 21 jan. 2023, In: Cell death discovery. 9, 1, blz. 21

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • M Phase Cell Cycle Checkpoints 100%
  • Metaplasia 80%
  • DNA Damage 64%
  • Breast 56%
  • Human Mammary Glands 40%
  6 Citaten (Scopus)

• Druggable growth dependencies and tumor evolution analysis in patient-derived organoids of neuroendocrine neoplasms from multiple body sites

  Dayton, T. L., Alcala, N., Moonen, L., den Hartigh, L., Geurts, V., Mangiante, L., Lap, L., Dost, A. F. M., Beumer, J., Levy, S., van Leeuwaarde, R. S., Hackeng, W. M., Samsom, K., Voegele, C., Sexton-Oates, A., Begthel, H., Korving, J., Hillen, L., Brosens, L. A. A., Lantuejoul, S., & 16 anderenJaksani, S., Kok, N. F. M., Hartemink, K. J., Klomp, H. M., Borel Rinkes, I. H. M., Dingemans, A-M., Valk, G. D., Vriens, M. R., Buikhuisen, W., van den Berg, J., Tesselaar, M., Derks, J., Speel, E. J., Foll, M., Fernández-Cuesta, L. & Clevers, H., 11 dec. 2023, In: Cancer Cell. 41, 12, blz. 2083-2099.e9

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Neuroendocrine Tumors 53%
  • Neuroendocrine Carcinoma 49%
  • Growth 38%
  • Large Cell Carcinoma 25%
  10 Citaten (Scopus)

• Druggable redox pathways against Mycobacterium abscessus in cystic fibrosis patient-derived airway organoids

  Leon-Icaza, S. A., Bagayoko, S., Vergé, R., Iakobachvili, N., Ferrand, C., Aydogan, T., Bernard, C., Sanchez Dafun, A., Murris-Espin, M., Mazières, J., Bordignon, P. J., Mazères, S., Bernes-Lasserre, P., Ramé, V., Lagarde, J-M., Marcoux, J., Bousquet, M-P., Chalut, C., Guilhot, C., Clevers, H., & 7 anderenPeters, P. J., Molle, V., Lugo-Villarino, G., Cam, K., Berry, L., Meunier, E. & Cougoule, C., aug. 2023, In: PLoS Pathogens. 19, 8, blz. e1011559

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Mycobacterium abscessus 100%
  • cystic fibrosis 82%
  • Organoids 79%
  • Cystic Fibrosis 58%
  • Oxidation-Reduction 57%
  3 Citaten (Scopus)

• Drug-repurposing screen on patient-derived organoids identifies therapy-induced vulnerability in KRAS-mutant colon cancer

  Mertens, S., Huismans, M. A., Verissimo, C. S., Ponsioen, B., Overmeer, R., Proost, N., van Tellingen, O., van de Ven, M., Begthel, H., Boj, S. F., Clevers, H., Roodhart, J. M. L., Bos, J. L. & Snippert, H. J. G., 25 apr. 2023, In: Cell Reports. 42, 4, blz. 112324

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Vinorelbine 100%
  • Drug Repositioning 79%
  • Organoids 75%
  • Colonic Neoplasms 52%
  • Vinca Alkaloid 44%
  23 Citaten (Scopus)

• Dual targeting of cancer metabolome and stress antigens affects transcriptomic heterogeneity and efficacy of engineered T cells

  Hernández-López, P., van Diest, E., Brazda, P., Heijhuurs, S., Meringa, A., Hoorens van Heyningen, L., Riillo, C., Schwenzel, C., Zintchenko, M., Johanna, I., Nicolasen, M. J. T., Cleven, A., Kluiver, T. A., Millen, R., Zheng, J., Karaiskaki, F., Straetemans, T., Clevers, H., de Bree, R., Stunnenberg, H. G., & 6 anderenPeng, W. C., Roodhart, J., Minguet, S., Sebestyén, Z., Beringer, D. X. & Kuball, J., 27 nov. 2023, (E-pub ahead of print) In: Nature Immunology.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Metabolome 100%
  • Antigens 56%
  • T-Lymphocytes 54%
  • T-Cell Antigen Receptor 45%
  • Neoplasms 28%
  2 Citaten (Scopus)

• Engineered human hepatocyte organoids enable CRISPR-based target discovery and drug screening for steatosis

  Hendriks, D., Brouwers, J. F., Hamer, K., Geurts, M. H., Luciana, L., Massalini, S., López-Iglesias, C., Peters, P. J., Rodríguez-Colman, M. J., Chuva de Sousa Lopes, S., Artegiani, B. & Clevers, H., nov. 2023, In: Nature Biotechnology. 41, 11, blz. 1567-1581 15 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Hepatocytes 100%
  • Lipogenesis 88%
  • Organoids 78%
  • Fatty acids 73%
  • Liver 71%
  56 Citaten (Scopus)

• Establishment, Maintenance, Differentiation, Genetic Manipulation, and Transplantation of Mouse and Human Lacrimal Gland Organoids

  Bannier-Hélaouët, M., Geurts, M. H., Korving, J., Begthel, H. & Clevers, H., 03 feb. 2023, In: Journal of Visualized Experiments. 192

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Ocular 97%
  • Physiology 92%
  • Lacrimal Apparatus 92%
  • Neurotransmitter 84%
  2 Citaten (Scopus)

• Ewing Sarcoma Single-cell Transcriptome Analysis Reveals Functionally Impaired Antigen-presenting Cells

  Visser, L. L., Bleijs, M., Margaritis, T., van de Wetering, M., Holstege, F. C. P. & Clevers, H., 24 okt. 2023, In: Cancer research communications. 3, 10, blz. 2158-2169 12 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Single-Cell Analysis 100%
  • Ewing's Sarcoma 90%
  • Antigen-Presenting Cells 78%
  • Gene Expression Profiling 76%
  • RNA Sequence Analysis 9%
  1 Citaat (Scopus)

• Functional and spatial proteomics profiling reveals intra- and intercellular signaling crosstalk in colorectal cancer

  Plattner, C., Lamberti, G., Blattmann, P., Kirchmair, A., Rieder, D., Loncova, Z., Sturm, G., Scheidl, S., Ijsselsteijn, M., Fotakis, G., Noureen, A., Lisandrelli, R., Böck, N., Nemati, N., Krogsdam, A., Daum, S., Finotello, F., Somarakis, A., Schäfer, A., Wilflingseder, D., & 10 anderenGonzalez Acera, M., Öfner, D., Huber, L. A., Clevers, H., Becker, C., Farin, H. F., Greten, F. R., Aebersold, R., de Miranda, N. F. C. C. & Trajanoski, Z., 15 dec. 2023, In: iScience. 26, 12, blz. 108399

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Proteomics 100%
  • Colorectal Neoplasms 86%
  • Organoids 47%
  • Phosphotransferases 42%
  • Tumor Microenvironment 37%
  4 Citaten (Scopus)

• Human airway and nasal organoids reveal escalating replicative fitness of SARS-CoV-2 emerging variants

  Li, C., Huang, J., Yu, Y., Wan, Z., Chiu, M. C., Liu, X., Zhang, S., Cai, J-P., Chu, H., Li, G., Chan, J. F-W., To, K. K-W., Yang, Z., Jiang, S., Yuen, K-Y., Clevers, H. & Zhou, J., 25 apr. 2023, In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 17, blz. e2300376120

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • SARS Virus 100%
  • Organoids 89%
  • Nose 54%
  • Giant Cells 31%
  • Immune Evasion 12%
  26 Citaten (Scopus)

• Hydrogel-in-hydrogel live bioprinting for guidance and control of organoids and organotypic cultures

  Urciuolo, A., Giobbe, G. G., Dong, Y., Michielin, F., Brandolino, L., Magnussen, M., Gagliano, O., Selmin, G., Scattolini, V., Raffa, P., Caccin, P., Shibuya, S., Scaglioni, D., Wang, X., Qu, J., Nikolic, M., Montagner, M., Galea, G. L., Clevers, H., Giomo, M., & 2 anderenDe Coppi, P. & Elvassore, N., 30 mei 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 3128

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Hydrogels 81%
  • Hydrogel 60%
  • organs 52%
  • spinal cord 36%
  28 Citaten (Scopus)

• Loss of LGR4/GPR48 causes severe neonatal salt wasting due to disrupted WNT signaling altering adrenal zonation

  Lucas, C., Sauter, K-S., Steigert, M., Mallet, D., Wilmouth, J., Olabe, J., Plotton, I., Morel, Y., Aeberli, D., Wagner, F., Clevers, H., Pandey, A. V., Val, P., Roucher-Boulez, F. & Flück, C. E., 15 feb. 2023, In: The journal of clinical investigation. 133, 4

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Zona Glomerulosa 100%
  • Salts 62%
  • Hypoaldosteronism 57%
  • Catenins 44%
  • Adrenal Cortex 42%
  5 Citaten (Scopus)

• Nanoblades allow high-level genome editing in murine and human organoids

  Tiroille, V., Krug, A., Bokobza, E., Kahi, M., Bulcaen, M., Ensinck, M. M., Geurts, M. H., Hendriks, D., Vermeulen, F., Larbret, F., Gutierrez-Guerrero, A., Chen, Y., Van Zundert, I., Rocha, S., Rios, A. C., Medaer, L., Gijsbers, R., Mangeot, P. E., Clevers, H., Carlon, M. S., & 2 anderenBost, F. & Verhoeyen, E., 12 sep. 2023, In: Molecular therapy. Nucleic acids. 33, blz. 57-74 18 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Gene Editing 93%
  • Guide RNA 35%
  • Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats 29%
  • Gene Knockout Techniques 20%
  4 Citaten (Scopus)

• Oncogenic signaling is coupled to colorectal cancer cell differentiation state

  Sell, T., Klotz, C., Fischer, M. M., Astaburuaga-García, R., Krug, S., Drost, J., Clevers, H., Sers, C., Morkel, M. & Blüthgen, N., 05 jun. 2023, In: Journal of Cell Biology. 222, 6

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Cell Differentiation 100%
  • Colorectal Neoplasms 97%
  • Organoids 53%
  • Mutation 45%
  • Neoplasms 39%
  1 Citaat (Scopus)

• One-step generation of tumor models by base editor multiplexing in adult stem cell-derived organoids

  Geurts, M. H., Gandhi, S., Boretto, M. G., Akkerman, N., Derks, L. L. M., van Son, G., Celotti, M., Harshuk-Shabso, S., Peci, F., Begthel, H., Hendriks, D., Schürmann, P., Andersson-Rolf, A., Chuva de Sousa Lopes, S. M., van Es, J. H., van Boxtel, R. & Clevers, H., 17 aug. 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 4998

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • stem cells 100%
  • Organoids 95%
  • mutations 84%
  • Adult Stem Cells 84%
  • multiplexing 69%
  10 Citaten (Scopus)

• Organoid cell fate dynamics in space and time

  Zheng, X., Betjes, M. A., Ender, P., Goos, Y. J., Huelsz-Prince, G., Clevers, H., van Zon, J. S. & Tans, S. J., 18 aug. 2023, In: Science advances. 9, 33, blz. eadd6480

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Cell Tracking 15%
  • Cell Lineage 11%
  • Back 10%
  • Stem Cells 8%
  1 Citaat (Scopus)

• Organoid models of fibrolamellar carcinoma mutations reveal hepatocyte transdifferentiation through cooperative BAP1 and PRKAR2A loss

  Rüland, L., Andreatta, F., Massalini, S., Chuva de Sousa Lopes, S., Clevers, H., Hendriks, D. & Artegiani, B., 03 mei 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 2377

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • mutations 88%
  • cancer 71%
  • Mutation 64%
  • Hepatocytes 63%
  10 Citaten (Scopus)

• Paecilomycone Inhibits Quorum Sensing in Gram-Negative Bacteria

  Beenker, W. A. G., Hoeksma, J., Bannier-Hélaouët, M., Clevers, H. & den Hertog, J., 15 mrt. 2023, (E-pub ahead of print) In: Microbiology spectrum. 11, 2, blz. e0509722

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • virulence 100%
  • Quorum Sensing 94%
  • quorum sensing 90%
  • Gram-Negative Bacteria 75%
  • Pseudomonas aeruginosa 73%
  4 Citaten (Scopus)

• Patient-derived head and neck cancer organoids allow treatment stratification and serve as a tool for biomarker validation and identification

  Millen, R., De Kort, W. W. B., Koomen, M., van Son, G. J. F., Gobits, R., Penning de Vries, B., Begthel, H., Zandvliet, M., Doornaert, P., Raaijmakers, C. P. J., Geurts, M. H., Elias, S. G., van Es, R. J. J., de Bree, R., Devriese, L. A., Willems, S. M., Kranenburg, O., Driehuis, E. & Clevers, H., 12 mei 2023, In: Med (New York, N.Y.). 4, 5, blz. 290-310.e12

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Head and Neck Neoplasms 76%
  • Biomarkers 49%
  • Therapeutics 12%
  • Radiotherapy 12%
  23 Citaten (Scopus)

• Patient-derived tumor organoids predict responses to irinotecan-based neoadjuvant chemoradiotherapy in patients with locally advanced rectal cancer

  Lv, T., Shen, L., Xu, X., Yao, Y., Mu, P., Zhang, H., Wan, J., Wang, Y., Guan, R., Li, X., Fu, G., Zhang, L., Wang, Y., Xia, F., Hu, C., Clevers, H., Zhang, Z. & Hua, G., 01 feb. 2023, In: International Journal of Cancer. 152, 3, blz. 524-535 12 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Organoids 100%
  • Irinotecan 89%
  • Chemoradiotherapy 81%
  • Rectal Neoplasms 78%
  • Area Under Curve 24%
  16 Citaten (Scopus)

• PGE2 alters chromatin through H2A.Z-variant enhancer nucleosome modification to promote hematopoietic stem cell fate

  Sporrij, A., Choudhuri, A., Prasad, M., Muhire, B., Fast, E. M., Manning, M. E., Weiss, J. D., Koh, M., Yang, S., Kingston, R. E., Tolstorukov, M. Y., Clevers, H. & Zon, L. I., 09 mei 2023, In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 19, blz. e2220613120

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Nucleosomes 100%
  • Hematopoietic Stem Cells 84%
  • Dinoprostone 82%
  • Chromatin 75%
  • Histones 39%
  1 Citaat (Scopus)

• Pharmaco-proteogenomic characterization of liver cancer organoids for precision oncology

  Ji, S., Feng, L., Fu, Z., Wu, G., Wu, Y., Lin, Y., Lu, D., Song, Y., Cui, P., Yang, Z., Sang, C., Song, G., Cai, S., Li, Y., Lin, H., Zhang, S., Wang, X., Qiu, S., Zhang, X., Hua, G., & 14 anderenLi, J., Zhou, J., Dai, Z., Wang, X., Ding, L., Wang, P., Gao, D., Zhang, B., Rodriguez, H., Fan, J., Clevers, H., Zhou, H., Sun, Y. & Gao, Q., 26 jul. 2023, In: Science Translational Medicine. 15, 706, blz. eadg3358

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Proteogenomics 100%
  • Organoids 78%
  • Liver Neoplasms 59%
  • Pharmacological Biomarkers 17%
  • lenvatinib 16%
  20 Citaten (Scopus)

• Report of the Assay Guidance Workshop on 3-Dimensional Tissue Models for Antiviral Drug Development

  Jordan, R., Ford-Scheimer, S. L., Alarcon, R. M., Atala, A., Borenstein, J. T., Brimacombe, K. R., Cherry, S., Clevers, H., Davis, M. I., Funnell, S. G. P., Gehrke, L., Griffith, L. G., Grossman, A. C., Hartung, T., Ingber, D. E., Kleinstreuer, N. C., Kuo, C. J., Lee, E. M., Mummery, C. L., Pickett, T. E., & 8 anderenRamani, S., Rosado-Olivieri, E. A., Struble, E. B., Wan, Z., Williams, M. S., Hall, M. D., Ferrer, M. & Markossian, S., 03 okt. 2023, In: Journal of Infectious Diseases. 228, Suppl 5, blz. S337-S354

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Drug Development 100%
  • Antiviral Agents 90%
  • National Center for Advancing Translational Sciences (U.S.) 67%
  • Education 66%
  • National Institute of Allergy and Infectious Diseases (U.S.) 27%
  1 Citaat (Scopus)

• Reuniting philosophy and science to advance cancer research

  Pradeu, T., Daignan-Fornier, B., Ewald, A., Germain, P-L., Okasha, S., Plutynski, A., Benzekry, S., Bertolaso, M., Bissell, M., Brown, J. S., Chin-Yee, B., Chin-Yee, I., Clevers, H., Cognet, L., Darrason, M., Farge, E., Feunteun, J., Galon, J., Giroux, E., Green, S., & 18 anderenGross, F., Jaulin, F., Knight, R., Laconi, E., Larmonier, N., Maley, C., Mantovani, A., Moreau, V., Nassoy, P., Rondeau, E., Santamaria, D., Sawai, C. M., Seluanov, A., Sepich-Poore, G. D., Sisirak, V., Solary, E., Yvonnet, S. & Laplane, L., okt. 2023, In: Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society. 98, 5, blz. 1668-1686 19 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Mutation 100%
  • neoplasms 90%
  • Neoplasms 38%
  • Clonal Evolution 23%
  • Literature 18%
  9 Citaten (Scopus)

• SARS-CoV-2 Omicron entry is type II transmembrane serine protease-mediated in human airway and intestinal organoid models

  Mykytyn, A. Z., Breugem, T. I., Geurts, M. H., Beumer, J., Schipper, D., van Acker, R., van den Doel, P. B., van Royen, M. E., Zhang, J., Clevers, H., Haagmans, B. L. & Lamers, M. M., 31 aug. 2023, In: Journal of Virology. 97, 8, blz. e0085123

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • SARS Virus 100%
  • Cathepsins 91%
  • cathepsins 90%
  • Organoids 89%
  • Serine Proteases 76%
  9 Citaten (Scopus)

• Targeted inhibition of Wnt signaling with a Clostridioides difficile toxin B fragment suppresses breast cancer tumor growth

  He, A., Tian, S., Kopper, O., Horan, D. J., Chen, P., Bronson, R. T., Sheng, R., Wu, H., Sui, L., Zhou, K., Tao, L., Wu, Q., Huang, Y., Shen, Z., Han, S., Chen, X., Chen, H., He, X., Robling, A. G., Jin, R., & 4 anderenClevers, H., Xiang, D., Li, Z. & Dong, M., nov. 2023, In: PLoS Biology. 21, 11, blz. e3002353

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • breast neoplasms 100%
  • Wnt Signalling Inhibitor 99%
  • Cisplatin 94%
  • Toxin 83%
  • toxins 71%
  2 Citaten (Scopus)

• Temporal morphogen gradient-driven neural induction shapes single expanded neuroepithelium brain organoids with enhanced cortical identity

  Pagliaro, A., Finger, R., Zoutendijk, I., Bunschuh, S., Clevers, H., Hendriks, D. & Artegiani, B., 28 nov. 2023, In: Nature Communications. 14, 1, blz. 7361

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Rosette Crystal 100%
  • Organoids 93%
  • brain 67%
  • induction 64%
  • Disorder 60%
  3 Citaten (Scopus)

• The role of macrophages in non-small cell lung cancer and advancements in 3D co-cultures

  Balážová, K., Clevers, H. & Dost, A. F. M., 21 feb. 2023, In: eLife. 12

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Immunomodulating Agent 100%
  • Coculture Techniques 56%
  • Non-Small Cell Lung Carcinoma 51%
  • Macrophages 40%
  • Organoids 28%
  8 Citaten (Scopus)

• Transcriptomic profile comparison reveals conservation of ionocytes across multiple organs

  Pou Casellas, C., Pleguezuelos-Manzano, C., Rookmaaker, M. B., Verhaar, M. C. & Clevers, H., 02 mrt. 2023, In: Scientific Reports. 13, 1, blz. 3516

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Epididymis 100%
  • Inner Ear 90%
  • Salivary Glands 86%
  • RNA Sequence Analysis 46%
  • Kidney 44%
  4 Citaten (Scopus)

• Tubuloid culture enables long-term expansion of functional human kidney tubule epithelium from iPSC-derived organoids

  Yousef Yengej, F. A., Jansen, J., Ammerlaan, C. M. E., Dilmen, E., Pou Casellas, C., Masereeuw, R., Hoenderop, J. G., Smeets, B., Rookmaaker, M. B., Verhaar, M. C. & Clevers, H., 07 feb. 2023, In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 6, blz. e2216836120

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Kidney Tubules 100%
  • Organoids 90%
  • Induced Pluripotent Stem Cells 77%
  • Epithelium 52%
  • Kidney 22%
  7 Citaten (Scopus)

• Unbiased transcription factor CRISPR screen identifies ZNF800 as master repressor of enteroendocrine differentiation

  Lin, L., DeMartino, J., Wang, D., van Son, G. J. F., van der Linden, R., Begthel, H., Korving, J., Andersson-Rolf, A., van den Brink, S., Lopez-Iglesias, C., van de Wetering, W. J., Balwierz, A., Margaritis, T., van de Wetering, M., Peters, P. J., Drost, J., van Es, J. H. & Clevers, H., 27 okt. 2023, In: Science. 382, 6669, blz. 451-458 8 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Enteroendocrine Cells 100%
  • Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats 80%
  • Transcription Factors 52%
  • Organoids 46%
  • Small Intestine 32%
  6 Citaten (Scopus)

• Uncovering the mode of action of engineered T cells in patient cancer organoids

  Dekkers, J. F., Alieva, M., Cleven, A., Keramati, F., Wezenaar, A. K. L., van Vliet, E. J., Puschhof, J., Brazda, P., Johanna, I., Meringa, A. D., Rebel, H. G., Buchholz, M-B., Barrera Román, M., Zeeman, A. L., de Blank, S., Fasci, D., Geurts, M. H., Cornel, A. M., Driehuis, E., Millen, R., & 18 anderenStraetemans, T., Nicolasen, M. J. T., Aarts-Riemens, T., Ariese, H. C. R., Johnson, H. R., van Ineveld, R. L., Karaiskaki, F., Kopper, O., Bar-Ephraim, Y. E., Kretzschmar, K., Eggermont, A. M. M., Nierkens, S., Wehrens, E. J., Stunnenberg, H. G., Clevers, H., Kuball, J., Sebestyen, Z. & Rios, A. C., jan. 2023, In: Nature Biotechnology. 41, 1, blz. 60-69 10 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • T-cells 100%
  • Organoids 88%
  • Tumors 69%
  • Heterogeneity 62%
  • Molecular Cluster 43%
  67 Citaten (Scopus)
• 2022

  A bipotential organoid model of respiratory epithelium recapitulates high infectivity of SARS-CoV-2 Omicron variant

  Chiu, M. C., Li, C., Liu, X., Yu, Y., Huang, J., Wan, Z., Xiao, D., Chu, H., Cai, J-P., Zhou, B., Sit, K-Y., Au, W-K., Wong, K. K-Y., Li, G., Chan, J. F-W., To, K. K-W., Chen, Z., Jiang, S., Clevers, H., Yuen, K. Y., & 1 anderenZhou, J., 17 jun. 2022, In: Cell discovery. 8, 1, blz. 57

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • SARS Virus 100%
  • Organoids 89%
  • Respiratory Mucosa 87%
  • Strain 47%
  • pH Value 28%
  35 Citaten (Scopus)

• Analysis of the glyco-code in pancreatic ductal adenocarcinoma identifies glycan-mediated immune regulatory circuits

  Rodriguez, E., Boelaars, K., Brown, K., Madunić, K., van Ee, T., Dijk, F., Verheij, J., Li, R. J. E., Schetters, S. T. T., Meijer, L. L., Le Large, T. Y. S., Driehuis, E., Clevers, H., Bruijns, S. C. M., O'Toole, T., van Vliet, S. J., Bijlsma, M. F., Wuhrer, M., Kazemier, G., Giovannetti, E., & 2 anderenGarcia-Vallejo, J. J. & van Kooyk, Y., 11 jan. 2022, In: Communications Biology. 5, 1, blz. 41

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • adenocarcinoma 100%
  • Polysaccharides 79%
  • Adenocarcinoma 66%
  • polysaccharides 65%
  • O-Glycan 41%
  11 Citaten (Scopus)

• A path to translation: How 3D patient tumor avatars enable next generation precision oncology

  18 okt. 2022, (E-pub ahead of print) In: Cancer Cell.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Precision Medicine 100%
  • Clinical Decision-Making 97%
  • Neoplasms 89%
  • Technology 60%
  • Therapeutics 30%
  11 Citaten (Scopus)

• BMP gradient along the intestinal villus axis controls zonated enterocyte and goblet cell states

  Beumer, J., Puschhof, J., Yengej, F. Y., Zhao, L., Martinez-Silgado, A., Blotenburg, M., Begthel, H., Boot, C., van Oudenaarden, A., Chen, Y-G. & Clevers, H., 01 mrt. 2022, In: Cell Reports. 38, 9, blz. 110438

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Bone Morphogenetic Proteins 100%
  • Goblet Cells 98%
  • Enterocytes 97%
  • Epithelial Cells 29%
  • Antimicrobial Agent 28%
  47 Citaten (Scopus)

• Cancer induces a stress ileopathy depending on B-adrenergic receptors and promoting dysbiosis that contribute to carcinogenesis

  Yonekura, S., Terrisse, S., Alves Costa Silva, C., Lafarge, A., Iebba, V., Ferrere, G., Goubet, A-G., Fahrner, J-E., Lahmar, I., Ueda, K., Mansouri, G., Pizzato, E., Ly, P., Mazzenga, M., Thelemaque, C., Fidelle, M., Jaulin, F., Cartry, J., Deloger, M., Aglave, M., & 27 anderenDroin, N., Opolon, P., Puget, A., Mann, F., Neunlist, M., Bessard, A., Aymeric, L., Matysiak-Budnik, T., Bosq, J., Hofman, P., Duong, C. P. M., Ugolini, S., Quiniou, V., Berrard, S., Ryffel, B., Kepp, O., Kroemer, G., Routy, B., Lordello, L., Bani, M-A., Segata, N., Yousef Yengej, F., Clevers, H., Scoazec, J-Y., Pasolli, E., Derosa, L. & Zitvogel, L., apr. 2022, In: Cancer Discovery.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  • Dysbiosis 100%
  • Adrenergic Receptors 76%
  • Carcinogenesis 61%
  • Clostridium 28%
  • Neoplasms 25%
  46 Citaten (Scopus)

• Colon Tumors in Enterotoxigenic Bacteroides fragilis (ETBF)-Colonized Mice Do Not Display a Unique Mutational Signature but Instead Possess Host-Dependent Alterations in the APC Gene

  Allen, J., Rosendahl Huber, A., Pleguezuelos-Manzano, C., Puschhof, J., Wu, S., Wu, X., Boot, C., Saftien, A., O'Hagan, H. M., Wang, H., van Boxtel, R., Clevers, H. & Sears, C. L., 29 jun. 2022, In: Microbiology spectrum. 10, 3, blz. e0105522

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • APC Genes 100%
  • Bacteroides fragilis 95%
  • tumor 75%
  • colon 70%
  • Colon 57%
  18 Citaten (Scopus)

• Differentiation and CRISPR-Cas9-mediated genetic engineering of human intestinal organoids

  Martinez-Silgado, A., Yousef Yengej, F. A., Puschhof, J., Geurts, V., Boot, C., Geurts, M. H., Rookmaaker, M. B., Verhaar, M. C., Beumer, J. & Clevers, H., 16 sep. 2022, In: STAR protocols. 3, 3, blz. 101639

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Genetic Engineering 95%
  • Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats 87%
  • Agonist 72%
  • Transcription Factor 3 37%
  4 Citaten (Scopus)

• Functional patient-derived organoid screenings identify MCLA-158 as a therapeutic EGFR × LGR5 bispecific antibody with efficacy in epithelial tumors

  Herpers, B., Eppink, B., James, M. I., Cortina, C., Cañellas-Socias, A., Boj, S. F., Hernando-Momblona, X., Glodzik, D., Roovers, R. C., van de Wetering, M., Bartelink-Clements, C., Zondag-van der Zande, V., Mateos, J. G., Yan, K., Salinaro, L., Basmeleh, A., Fatrai, S., Maussang, D., Lammerts van Bueren, J. J., Chicote, I., & 19 anderenSerna, G., Cabellos, L., Ramírez, L., Nuciforo, P., Salazar, R., Santos, C., Villanueva, A., Stephan-Otto Attolini, C., Sancho, E., Palmer, H. G., Tabernero, J., Stratton, M. R., de Kruif, J., Logtenberg, T., Clevers, H., Price, L. S., Vries, R. G. J., Batlle, E. & Throsby, M., apr. 2022, In: Nature cancer. 3, 4, blz. 418-436 19 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • 2-methyl-6-(4-methoxyphenyl)-3,7-dihydroimidazo(1,2-alpha)pyrazin-3-one 100%
  • Bispecific Antibodies 71%
  • Organoids 66%
  • Neoplastic Stem Cells 35%
  • Colorectal Neoplasms 26%
  62 Citaten (Scopus)

• Human liver organoids for disease modeling of fibrolamellar carcinoma

  Narayan, N. J. C., Requena, D., Lalazar, G., Ramos-Espiritu, L., Ng, D., Levin, S., Shebl, B., Wang, R., Hammond, W. J., Saltsman, J. A., Gehart, H., Torbenson, M. S., Clevers, H., LaQuaglia, M. P. & Simon, S. M., 09 aug. 2022, In: Stem Cell Reports. 17, 8, blz. 1874-1888 15 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Liver Diseases 64%
  • Carcinoma 50%
  • Lethal 45%
  • Drug 40%
  11 Citaten (Scopus)

• In vitro grafting of hepatic spheroids and organoids on a microfluidic vascular bed

  Bonanini, F., Kurek, D., Previdi, S., Nicolas, A., Hendriks, D., de Ruiter, S., Meyer, M., Clapés Cabrer, M., Dinkelberg, R., García, S. B., Kramer, B., Olivier, T., Hu, H., López-Iglesias, C., Schavemaker, F., Walinga, E., Dutta, D., Queiroz, K., Domansky, K., Ronden, B., & 6 anderenJoore, J., Lanz, H. L., Peters, P. J., Trietsch, S. J., Clevers, H. & Vulto, P., nov. 2022, In: Angiogenesis. 25, 4, blz. 455-470 16 blz.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Organoids 100%
  • Microfluidics 91%
  • Azathioprine 62%
  • Robotics 46%
  • Liver Transplantation 46%
  46 Citaten (Scopus)

• Loss of Rnf43 accelerates Kras-mediated neoplasia and remodels the tumor immune microenvironment in pancreatic adenocarcinoma

  Hosein, A. N., Dangol, G., Okumura, T., Roszik, J., Rajapakshe, K., Siemann, M., Zaid, M., Ghosh, B., Monberg, M., Guerrero, P. A., Singhi, A., Haymaker, C. L., Clevers, H., Abou-Elkacem, L., Woermann, S. M. & Maitra, A., apr. 2022, In: Gastroenterology.

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Tumor Microenvironment 100%
  • Adenocarcinoma 75%
  • Neoplasms 31%
  • RNA Sequence Analysis 21%
  • Chemokine CXCL5 17%
  30 Citaten (Scopus)

• Mapping prohormone processing by proteases in human enteroendocrine cells using genetically engineered organoid models

  Beumer, J., Bauzá-Martinez, J., Veth, T. S., Geurts, V., Boot, C., Gilliam-Vigh, H., Poulsen, S. S., Knop, F. K., Wu, W. & Clevers, H., 16 nov. 2022, In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 46, blz. e2212057119

  Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

  Open Access

  • Enteroendocrine Cells 100%
  • Organoids 92%
  • Peptide Hydrolases 58%
  • Exopeptidases 25%
  • Endopeptidases 21%
  5 Citaten (Scopus)