19982019

Onderzoeksoutput per jaar

Als u wijzigingen in Pure hebt gemaakt, zullen deze hier binnenkort zichtbaar zijn.

Onderzoeksoutput

2019

Environmental filtering: A case of bacterial community assembly in soil

Yan, Y., Klinkhamer, P. G. L., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2019, In : Soil Biology & Biochemistry. 136, 107531.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

High-level abundance of Methanobacteriales and Syntrophobacterales may help to prevent corrosion of metal sheet piles

in 't Zandt, M. H., Kip, N., Frank, J., Jansen, S., van Veen, J. A., Jetten, M. S. M. & Welte, C. U., 2019, In : Applied and Environmental Microbiology. 85, 20, AEM.01369-19.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Moisture is more important than Temperature for Assembly of Both Potentially Active and Whole Prokaryotic Communities in Subtropical Grassland

Lupatini, M., Suleiman, A. K. A., Jacques, R. J. S., Pylro, V. S., van Veen, J. A., Kuramae, E. E. & Roesch, L. F. W., 2019, In : Microbial Ecology. 77, 2, blz. 460-470

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Nitrification inhibitors effectively target N2O-producing Nitrosospira spp. in tropical soil

Cassman, N., Soares, J. R., Pijl, A. S., Lourenço, K. S., van Veen, J. A., Cantarella, H. & Kuramae, E. E., 2019, In : Environmental Microbiology. 21, 4, blz. 1241-1254

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
351 Downloads (Pure)
2018

Co-variation of bacterial and fungal communities in different sorghum cultivars and growth stages is soil dependent

Schlemper, T. R., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2018, In : Microbial Ecology. 76, 1, blz. 205-214

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
261 Downloads (Pure)

Dominance of bacterial ammonium oxidizers and fungal denitrifiers in the complex nitrogen cycle pathways related to nitrous oxide emission

Lourenço, K. S., Dimitrov, M., Pijl, A. S., Soares, J. R., do Carmo, J. B., van Veen, J. A., Cantarella, H. & Kuramae, E. E., 2018, In : GCB Bioenergy. 10, 9, blz. 645-660

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
462 Downloads (Pure)

Effect of Burkholderia tropica and Herbaspirillum frisingense strains on sorghum growth is plant genotype dependent

Schlemper, T. R., Dimitrov, M., Silva Gutierrez, F., van Veen, J. A., Silveira, A. P. D. & Kuramae, E. E., 2018, In : PeerJ. 6, e5346.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
235 Downloads (Pure)

Nitrosospira sp. govern nitrous oxide emissions in a tropical soil amended with residues of bioenergy crop

Lourenço, K. S., Cassman, N., Pijl, A. S., van Veen, J. A., Cantarella, H. & Kuramae, E. E., 2018, In : Frontiers in Microbiology. 9, 674.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
149 Downloads (Pure)

Resilience of the resident soil microbiome to organic and inorganic amendment disturbances and to temporary bacterial invasion

Lourenço, K. S., Suleiman, A. K. A., Pijl, A. S., van Veen, J. A., Cantarella, H. & Kuramae, E. E., 2018, In : Microbiome. 6, 142.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
202 Downloads (Pure)
2017

Characterization of novel Acidobacteria exopolysaccharides with potential industrial and ecological applications

Kielak, A. M., Castellane, T. C. L., Campanharo, J. C., Colnago, L. A., Costa, O. Y. A., Corradi da Silva, M. L., van Veen, J. A., Lemos, E. G. & Kuramae, E. E., 2017, In : Scientific Reports. 7, 41193.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
192 Downloads (Pure)

Functional traits dominate the diversity-related selection of bacterial communities in the rhizosphere

Yan, Y., Kuramae, E. E., De Hollander, M., Klinkhamer, P. G. L. & van Veen, J. A., 2017, In : ISME Journal. 11, blz. 56-66

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

31 Downloads (Pure)

Methanogens predominate in natural corrosion protective layers on metal sheet piles.

Kip, N., Jansen, S., Leite, M. F. A., De Hollander, M., Afanasyev, M., Kuramae, E. E. & van Veen, J. A., 2017, In : Scientific Reports. 7, 11899.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
196 Downloads (Pure)

Rhizobacterial community structure differences among sorghum cultivars in different growth stages and soils

Schlemper, T. R., Leite, M. F. A., Reis Lucheta, A., Shimels, M., Bouwmeester, H. J., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2017, In : FEMS Microbiology Ecology. 93, 8, fix096.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

Shifts in rhizosphere fungal community during secondary succession following abandonment from agriculture

Hannula, S. E., Morriën, E., De Hollander, M., van der Putten, W. H., van Veen, J. A. & De Boer, W., 2017, In : ISME Journal. 11, blz. 2294-2304

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
273 Downloads (Pure)

Soil networks become more connected and take up more carbon as nature restoration progresses

Morriën, E., Hannula, S. E., Snoek, B., Helmsing, N. R., Zweers, H., De Hollander, M., Lujan Soto, R., Bouffaud, M. L., Buée, M., Dimmers, W., Duyts, H., Geisen, S., Girlanda, M., Griffiths, R. I., Jørgensen, H-B., Jensen, J., Plassart, P., Redecker, D., Schmelz, R. M., Schmidt, O. & 12 anderen, Thomson, B. C., Tisserant, E., Uroz, S., Winding, A., Bailey, M. J., Bonkowski, M., Faber, J. H., Martin, F., Lemanceau, P., De Boer, W., van Veen, H. & van der Putten, W. H., 2017, In : Nature Communications. 8, 14349.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
244 Downloads (Pure)

Successive DNA extractions improve characterization of soil microbial communities

Dimitrov, M. R., Veraart, A. J., De Hollander, M., Smidt, H., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2017, In : PeerJ. 5, e2915.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
445 Downloads (Pure)
2016

Bacterial community succession in pine-wood decomposition

Kielak, A., Scheublin, T., Mendes, L. W., Van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2016, In : Frontiers in Microbiology. 7, 00231.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
202 Downloads (Pure)

Genomic comparison of chitinolytic enzyme systems from terrestrial and aquatic bacteria

Bai, Y., Eijsink, V. G. H., Kielak, A. M., Van Veen, J. A. & De Boer, W., 2016, In : Environmental Microbiology. 18, 1, blz. 38-49

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

12 Downloads (Pure)

Plant and soil fungal but not soil bacterial communities are linked in long-term fertilized grassland.

Cassman, N., Leite, M. F. A., Pan, Y., De Hollander, M., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2016, In : Scientific Reports. 6, 23680.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
209 Downloads (Pure)

Primer Sets Developed for Functional Genes Reveal Shifts in Functionality of Fungal Community in Soils

Hannula, S. E. & van Veen, J. A., 2016, In : Frontiers in Microbiology. 7, fmicb.2016.01897.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
132 Downloads (Pure)

The ecology of Acidobacteria: moving beyond genes and genomes

Kielak, A. M., Barreto, C. C., Kowalchuk, G. A., van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2016, In : Frontiers in Microbiology. 744.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
381 Downloads (Pure)
2015

Antifungal rhizosphere bacteria can increase as response to the presence of saprotrophic fungi

De Boer, W., Hundscheid, M. P. J., Klein Gunnewiek, P. J. A., De Ridder-Duine, A. S., Thion, C., van Veen, J. A. & Van der Wal, A., 2015, In : PLoS One. 10, 9, e0137988.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
289 Downloads (Pure)

Baiting of bacteria with hyphae of common soil fungi revealed a diverse group of potentially mycophagous secondary consumers in the rhizosphere

Rudnick, M. B., van Veen, J. A. & de Boer, W., 2015, In : Soil Biology & Biochemistry. 88, September, blz. 73-82

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
130 Downloads (Pure)

Exploring the genomic traits of fungus-feeding bacterial genus Collimonas

Song, C., Schmidt, R. L., de Jager, V. C. L., Krzyzanowska, D., Jongedijk, E., Cankar, K., Beekwilder, J., van Veen, A., De Boer, W., van Veen, J. A. & Garbeva, P. V., 2015, In : BMC Genomics. 16, 1103.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
234 Downloads (Pure)

Oxalic acid: a signal molecule for fungus-feeding bacteria of the genus Collimonas?

Rudnick, M. B., van Veen, J. A. & De Boer, W., 2015, In : Environmental Microbiology Reports. 7, 5, blz. 709-714

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

7 Downloads (Pure)

Revisiting the dilution procedure used to manipulate microbial biodiversity in terrestrial systems revisited

Yan, Y., Kuramae, E. E., Klinkhamer, P. G. L. & Van Veen, J. A., 2015, In : Applied and Environmental Microbiology. 81, 13, blz. 4246-4252

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
523 Downloads (Pure)

Soil-borne microbiome: linking diversity to function

Mendes, L. M., Tsai, S. M., Navarrete, A. A., De Hollander, M., Van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2015, In : Microbial Ecology. 70, 1, blz. 255-265

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

8 Downloads (Pure)

Soil conditions and land use intensification effects on soil microbial communities across a range of European field sites

Thomson, B. C., Tisserant, E., Plassart, P., Uroz, S., Griffiths, R. I., Hannula, S. E., Buée, M., Mougel, C., Ranjard, L., Van Veen, J. A., Martin, F., Bailey, M. J. & Lemanceau, P., 2015, In : Soil Biology & Biochemistry. 88, September

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

6 Downloads (Pure)

Soil microbiome responses to the short-term effects of Amazonian deforestation

Navarrete, A. A., Tsai, S. M., Mendes, L. W., Faust, K., De Hollander, M., Cassman, N., Raes, J., Van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2015, In : Molecular Ecology. 24, 10, blz. 2433-2448

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

3 Downloads (Pure)

The dual role of microbes in corrosion

Kip, D. J. & Van Veen, J. A., 2015, In : ISME Journal. 9, blz. 542-551

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

6 Downloads (Pure)

Verrucomicrobial community structure and size as indicators for changes in chemical factors linked to soil fertility

Navarrete, A. A., Soares, T., Rosetto, R., Van Veen, J. A., Tsai, S. M. & Kuramae, E. E., 2015, In : Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology. 108, 3, blz. 741-752

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
320 Downloads (Pure)
2014

Biosynthetic genes and activity spectrum of antifungal polyynes from Collimonas fungivorans Ter331

Fritsche, K., Van den Berg, M., De Boer, W., Van Beek, T. A., Raaijmakers, J. M., Van Veen, J. A. & Leveau, J. H. J., 2014, In : Environmental Microbiology. 16, 5, blz. 1334-1345

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
354 Downloads (Pure)

Do genetic modifications in crops affect soil fungi? a review

Hannula, S. E., De Boer, W. & Van Veen, J. A., 2014, In : Biology and Fertility of Soils. 50, 3, blz. 433-446

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
601 Downloads (Pure)

Impact of interspecific interactions on antimicrobial activity among soil bacteria

Tyc, O., Van den Berg, M., Gerards, S., Van Veen, J. A., Raaijmakers, J., De Boer, W. & Garbeva, P., 2014, In : Frontiers in Microbiology. 5, 567.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
530 Downloads (Pure)

Impact of long term N, P, K and NPK fertilization on the composition and potential functions of bacterial community in grassland soil

Pan, Y., Cassman, N., De Hollander, M., Mendes, L. W., Korevaar, H., Geerts, R. H. E. M., Van Veen, J. A. & Kuramae, E. E., 2014, In : FEMS Microbiology Ecology. 90, 1, blz. 195-205

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

5 Downloads (Pure)

Soil-borne microbial functional structure across different land uses

Kuramae, E. E., Zhou, J., Kowalchuk, G. A. & Van Veen, J. A., 2014, In : The Scientific World Journal. 2014, blz. 216071

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
326 Downloads (Pure)

Taxonomical and functional microbial community selection in soybean rhizosphere

Mendes, L. W., Kuramae, E. E., Navarrete, A. A., Van Veen, J. A. & Tsai, S. M., 2014, In : ISME Journal. 8, blz. 1577-1587

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2013

Acidobacterial community responses to agricultural management of soybean in Amazon forest soils

Navarrete, A. A., Kuramae, E. E., De Hollander, M., Pijl, A. S., Van Veen, J. A. & Tsai, S. M., 2013, In : FEMS Microbiology Ecology. 83, 3, blz. 607-621

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
646 Downloads (Pure)

Different Selective Effects on Rhizosphere Bacteria Exerted by Genetically Modified versus Conventional Potato Lines

Franco Dias, A. C., Dini-Andreote, F., Hannula, S. E., de Cassia Pereira e Silva, M., Salles, J., De Boer, W., Van Veen, J. A. & Van Elsas, J. D., 2013, In : PLoS One. 8, 7, e67948.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
419 Downloads (Pure)

Effect of genetic modification of potato starch on decomposition of leaves and tubers and on fungal decomposer communities

Hannula, S. E., De Boer, W., Baldrian, P. & Van Veen, J. A., 2013, In : Soil Biology & Biochemistry. 58, blz. 88-98

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Impacts of 3 years of elevated atmospheric CO2 on rhizosphere carbon flow and microbial community dynamics

Drigo, B., Kowalchuk, G. A., Knapp, B. A., Pijl, A. S., Boschker, H. T. S. & Van Veen, J. A., 2013, In : Global Change Biology. 19, 2, blz. 621-636

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Soil and Freshwater and Marine Sediment Food Webs: Their Structure and Function

Krumins, J. A., Van Oevelen, D., Bezemer, T. M., De Deyn, G. B., Hol, W. H. G., Van Donk, E., De Boer, W., De Ruiter, P. C., Middelburg, J. J., Monroy, F., Soetaert, K. E. R., Thebault, E., Van de Koppel, J., Van Veen, J. A., Viketoft, M. & Van der Putten, W. H., 2013, In : BioScience. 63, 1, blz. 35-42

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

14 Downloads (Pure)

Soil microbial diversity patterns of a lowland spring environment

Vasileiadis, S., Puglisi, E., Arena, M., Cappa, F., Van Veen, J. A., Cocconcelli, P. S. & Trevisan, M., 2013, In : FEMS Microbiology Ecology. 86, 2, blz. 172-184

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2012

13C pulse-labeling assessment of the community structure of active fungi in the rhizosphere of a genetically starch-modified potato (Solanum tuberosum) cultivar and its parental isoline

Hannula, S. E., Boschker, H. T. S., De Boer, W. & Van Veen, J. A., 2012, In : New Phytologist. 194, 3, blz. 784-799

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2 Downloads (Pure)

A 3-year study reveals that plant growth stage, season and field site affect soil fungal communities while cultivar and GM-trait have minor effects

Hannula, S. E., De Boer, W. & Van Veen, J. A., 2012, In : PLoS One. 7, 4, e33819.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
320 Downloads (Pure)

Characterization of bacterial isolates from rotting potato tuber tissue showing antagonism to Dickeya sp. biovar 3 in vitro and in planta

Czajkowski, R. L., De Boer, W. J., Van Veen, J. A. & Van der Wolf, J. M., 2012, In : Plant Pathology. 61, 1, blz. 169-182

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
4 Downloads (Pure)

Comparative genomics of bacteria from the genus Collimonas: linking (dis)similarities in gene content to phenotypic variation and conservation

Mela, F., Fritsche, K., De Boer, W., Van den Berg, M., Van Veen, J. A., Maharaj, N. N. & Leveau, J. H. J., 2012, In : Environmental Microbiology Reports. 4, 4, blz. 424-432

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

General Surveillance of the soil ecosystem: An approach to monitoring unexpected adverse effects of GMO's

Smit, E., Bakker, P. A. H. M., Bergmans, H., Bloem, J., Griffiths, B. S., Rutgers, M., Sanvido, O., Singh, B. K., Van Veen, J. A., Wilhelm, R. & Glandorf, D. C. M., 2012, In : Ecological Indicators. 14, 1, blz. 107-113

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

1 Downloads (Pure)

Microbiële diversiteit

Van Veen, H., 2012, Biodiversiteit. van den Broek, J., Eijsackers, H., van Straalen, N. & Evenblij, M. (redactie). Stichting Biowetenschappen en Maatschappij, Vol. kwartaal 4. blz. 26-27 (Cahier Bio-Wetenschappen en Maatschappij).

Onderzoeksoutput: Hoofdstuk in boek/boekdeelHoofdstukProfessioneel

MicroLife Solutions

Van Veen, J. A., 2012, Wageningen: Final report on the NGI project.

Onderzoeksoutput: Boek/RapportRapportProfessioneel