20112020

Onderzoeksoutput per jaar

Als u wijzigingen in Pure hebt gemaakt, zullen deze hier binnenkort zichtbaar zijn.

Onderzoeksoutput

2020

Hominin-specific regulatory elements selectively emerged in oligodendrocytes and are disrupted in autism patients

Castelijns, B., Baak, M. L., Timpanaro, I. S., Wiggers, C. R. M., Vermunt, M. W., Shang, P., Kondova, I., Geeven, G., Bianchi, V., de Laat, W., Geijsen, N. & Creyghton, M. P., 16 jan 2020, In : Nature Communications. 11, 1, blz. 301

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2019

AML Subtype Is a Major Determinant of the Association between Prognostic Gene Expression Signatures and Their Clinical Significance

Wiggers, C. R. M., Baak, M. L., Sonneveld, E., Nieuwenhuis, E. E. S., Bartels, M. & Creyghton, M. P., 10 sep 2019, In : Cell Reports. 28, 11, blz. 2866-2877.e5

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Mapping the Global Chromatin Connectivity Network for Sox2 Function in Neural Stem Cell Maintenance

Bertolini, J. A., Favaro, R., Zhu, Y., Pagin, M., Ngan, C. Y., Wong, C. H., Tjong, H., Vermunt, M. W., Martynoga, B., Barone, C., Mariani, J., Cardozo, M. J., Tabanera, N., Zambelli, F., Mercurio, S., Ottolenghi, S., Robson, P., Creyghton, M. P., Bovolenta, P., Pavesi, G. & 3 anderen, Guillemot, F., Nicolis, S. K. & Wei, C-L., 07 mrt 2019, In : Cell Stem Cell. 24, 3, blz. 462-476.e6

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Transcriptomic and Epigenomic Profiling of Histone Deacetylase Inhibitor Treatment Reveals Distinct Gene Regulation Profiles Leading to Impaired Neutrophil Development

Govers, A. M. A. P., Wiggers, C. R. M., van Boxtel, R., Mokry, M., Nieuwenhuis, E. E. S., Creyghton, M. P., Bartels, M. & Coffer, P. J., aug 2019, In : HemaSphere. 3, 4, blz. e270

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2018

Intracranial Aneurysm-Associated Single-Nucleotide Polymorphisms Alter Regulatory DNA in the Human Circle of Willis

Laarman, M. D., Vermunt, M. W. & Ruigrok, Y. M., feb 2018, In : Stroke. 49, 2, blz. 447-453 7 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
186 Downloads (Pure)
2017

Circadian networks in human embryonic stem cell-derived cardiomyocytes

Dierickx, P., Vermunt, M. W., Muraro, M. J., Creyghton, M. P., Doevendans, P. A., van Oudenaarden, A., Geijsen, N. & Van Laake, L. W., jul 2017, In : EMBO Reports. 18, 7, blz. 1199-1212 14 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Tomo-Seq Identifies SOX9 as a Key Regulator of Cardiac Fibrosis During Ischemic Injury

Lacraz, G. P. A., Junker, J. P., Gladka, M. M., Molenaar, B., Scholman, K. T., Vigil-Garcia, M., Versteeg, D., de Ruiter, H., Vermunt, M. W., Creyghton, M. P., Huibers, M. M. H., de Jonge, N., van Oudenaarden, A. & van Rooij, E., 10 okt 2017, In : Circulation. 136, 15, blz. 1396-1409 14 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2016

Cdx and T Brachyury Co-activate Growth Signaling in the Embryonic Axial Progenitor Niche

Amin, S., Neijts, R., Simmini, S., van Rooijen, C., Tan, S. C., Kester, L., van Oudenaarden, A., Creyghton, M. P. & Deschamps, J., 20 dec 2016, In : Cell Reports. 17, 12, blz. 3165-3177 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Epigenomic annotation of gene regulatory alterations during evolution of the primate brain

Vermunt, M. W., Tan, S. C., Castelijns, B., Geeven, G., Reinink, P., de Bruijn, E., Kondova, I., Persengiev, S., Bontrop, R., Cuppen, E., de Laat, W. & Creyghton, M. P., mrt 2016, In : Nature Neuroscience. 19, 3, blz. 494-503 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Genome-wide DNA methylation levels and altered cortisol stress reactivity following childhood trauma in humans

Houtepen, L. C., Vinkers, C. H., Carrillo-Roa, T., Hiemstra, M., van Lier, P. A., Meeus, W., Branje, S., Heim, C. M., Nemeroff, C. B., Mill, J., Schalkwyk, L. C., Creyghton, M. P., Kahn, R. S., Joëls, M., Binder, E. B. & Boks, M. P. M., 19 mrt 2016, In : Nature Communications. 7, blz. 10967

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Polarized regulatory landscape and Wnt responsiveness underlie Hox activation in embryos

Neijts, R., Amin, S., van Rooijen, C., Tan, S., Creyghton, M. P., de Laat, W. & Deschamps, J., 01 sep 2016, In : Genes & Development. 30, 17, blz. 1937-42 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Transcriptional Dynamics at Brain Enhancers: from Functional Specialization to Neurodegeneration

Vermunt, M. W. & Creyghton, M. P., 2016, In : Current Neurology and Neuroscience Reports. 16, 10, blz. 94

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2015

Inhibition of Super-Enhancer Activity in Autoinflammatory Site-Derived T Cells Reduces Disease-Associated Gene Expression

Peeters, J. G. C., Vervoort, S. J., Tan, S. C., Mijnheer, G., de Roock, S., Vastert, S. J., Nieuwenhuis, E. E. S., van Wijk, F., Prakken, B. J., Creyghton, M. P., Coffer, P. J., Mokry, M. & van Loosdregt, J., 29 sep 2015, In : Cell Reports. 12, 12, blz. 1986-96 11 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access

Local compartment changes and regulatory landscape alterations in histone H1-depleted cells

Geeven, G., Zhu, Y., Kim, B. J., Bartholdy, B. A., Yang, S-M., Macfarlan, T. S., Gifford, W. D., Pfaff, S. L., Verstegen, M. J. A. M., Pinto, H., Vermunt, M. W., Creyghton, M. P., Wijchers, P. J., Stamatoyannopoulos, J. A., Skoultchi, A. I. & de Laat, W., 2015, In : Genome Biology. 16, 1, blz. 289

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2014

Histone acetylation in astrocytes suppresses GFAP and stimulates a reorganization of the intermediate filament network

Kanski, R., Sneeboer, M. A. M., van Bodegraven, E. J., Sluijs, J. A., Kropff, W., Vermunt, M. W., Creyghton, M. P., De Filippis, L., Vescovi, A., Aronica, E., van Tijn, P., van Strien, M. E. & Hol, E. M., 15 okt 2014, In : Journal of Cell Science. 127, Pt 20, blz. 4368-80 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
Bestand
206 Downloads (Pure)

Large-scale identification of coregulated enhancer networks in the adult human brain

Vermunt, M. W., Reinink, P., Korving, J., de Bruijn, E., Creyghton, M. P., Basak, O., Geeven, G., Toonen, P. W., Lansu, N., Meunier, C., van Heesch, S., Clevers, H., de Laat, W., Cuppen, E. & Creyghton, M. P., 23 okt 2014, In : Cell Reports. 9, 2, blz. 767-79 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

Open Access
2012

X-linked H3K27me3 demethylase Utx is required for embryonic development in a sex-specific manner

Welstead, G. G., Creyghton, M. P., Bilodeau, S., Cheng, A. W., Markoulaki, S., Young, R. A. & Jaenisch, R., 2012, In : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 32, blz. 13004-13009

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review

2011

Reprogramming factor stoichiometry influences the epigenetic state and biological properties of induced pluripotent stem cells

Carey, B. W., Markoulaki, S., Hanna, J. H., Faddah, D. A., Buganim, Y., Kim, J., Ganz, K., Steine, E. J., Cassady, J. P., Creyghton, M. P., Welstead, G. G., Gao, Q. & Jaenisch, R., 2011, In : Cell Stem Cell. 9, 6, blz. 588-598

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgaveArtikelWetenschappelijkpeer review