Wouter de Laat

2015

YAP Drives Growth by Controlling Transcriptional Pause Release from Dynamic Enhancers

Galli, G. G., Carrara, M., Yuan, W-C., Valdes-Quezada, C., Gurung, B., Pepe-Mooney, B., Zhang, T., Geeven, G., Gray, N. S., de Laat, W., Calogero, R. A. & Camargo, F. D., 15 okt. 2015, In: Molecular Cell. 60, 2, blz. 328-37 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

223 Citaten (Scopus)

2014

A common genetic variant within SCN10A modulates cardiac SCN5A expression

van den Boogaard, M., Smemo, S., Burnicka-Turek, O., Arnolds, D. E., van de Werken, H. J. G., Klous, P., McKean, D., Muehlschlegel, J. D., Moosmann, J., Toka, O., Yang, X. H., Koopmann, T. T., Adriaens, M. E., Bezzina, C. R., de Laat, W., Seidman, C., Seidman, J. G., Christoffels, V. M., Nobrega, M. A., Barnett, P., & 1 anderenMoskowitz, I. P., 01 apr. 2014, In: Journal of Clinical Investigation. 124, 4, blz. 1844-52 9 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

155 Citaten (Scopus)

281 Downloads (Pure)

A large permissive regulatory domain exclusively controls Tbx3 expression in the cardiac conduction system

van Weerd, J. H., Badi, I., van den Boogaard, M., Stefanovic, S., van de Werken, H. J. G., Gomez-Velazquez, M., Badia-Careaga, C., Manzanares, M., de Laat, W., Barnett, P. & Christoffels, V. M., 01 aug. 2014, In: Circulation Research. 115, 4, blz. 432-41 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

37 Citaten (Scopus)

A single oncogenic enhancer rearrangement causes concomitant EVI1 and GATA2 deregulation in leukemia

Gröschel, S., Sanders, M. A., Hoogenboezem, R., de Wit, E., Bouwman, B. A. M., Erpelinck, C., van der Velden, V. H. J., Havermans, M., Avellino, R., van Lom, K., Rombouts, E. J., van Duin, M., Döhner, K., Beverloo, H. B., Bradner, J. E., Döhner, H., Löwenberg, B., Valk, P. J. M., Bindels, E. M. J., de Laat, W., & 1 anderenDelwel, R., 10 apr. 2014, In: Cell. 157, 2, blz. 369-81 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

525 Citaten (Scopus)

Large-scale identification of coregulated enhancer networks in the adult human brain

Vermunt, M. W., Reinink, P., Korving, J., de Bruijn, E., Creyghton, M. P., Basak, O., Geeven, G., Toonen, P. W., Lansu, N., Meunier, C., van Heesch, S., Clevers, H., de Laat, W., Cuppen, E. & Creyghton, M. P., 23 okt. 2014, In: Cell Reports. 9, 2, blz. 767-79 13 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

69 Citaten (Scopus)

Targeted sequencing by proximity ligation for comprehensive variant detection and local haplotyping

de Vree, P. J. P., de Wit, E., Yilmaz, M., van de Heijning, M., Klous, P., Verstegen, M. J. A. M., Wan, Y., Teunissen, H., Krijger, P. H. L., Geeven, G., Eijk, P. P., Sie, D., Ylstra, B., Hulsman, L. O. M., van Dooren, M. F., van Zutven, L. J. C. M., van den Ouweland, A., Verbeek, S., van Dijk, K. W., Cornelissen, M., & 19 anderenDas, A. T., Berkhout, B., Sikkema-Raddatz, B., van den Berg, E., van der Vlies, P., Weening, D., den Dunnen, J. T., Matusiak, M., Lamkanfi, M., Ligtenberg, M. J. L., ter Brugge, P., Jonkers, J., Foekens, J. A., Martens, J. W., van der Luijt, R., van Amstel, H. K. P., van Min, M., Splinter, E. & de Laat, W., okt. 2014, In: Nature Biotechnology. 32, 10, blz. 1019-25 7 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

211 Citaten (Scopus)

2013

Allelic exclusion of the immunoglobulin heavy chain locus is independent of its nuclear localization in mature B cells

Holwerda, S. J., van de Werken, H. J., Ribeiro de Almeida, C., Bergen, I. M., de Bruijn, M. J., Verstegen, M. J., Simonis, M., Splinter, E., Wijchers, P. J., Hendriks, R. W. & de Laat, W., 2013, In: Nucleic Acids Research. 41, 14, blz. 6905-6916

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

24 Citaten (Scopus)

CTCF: the protein, the binding partners, the binding sites and their chromatin loops

Holwerda, S. J. & de Laat, W., 2013, In: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 368, 1620, blz. 20120369

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

163 Citaten (Scopus)

DNA methylation dynamics during intestinal stem cell differentiation reveals enhancers driving gene expression in the villus

Kaaij, L. T., van de Wetering, M., Fang, F., Decato, B., Molaro, A., van de Werken, H. J., van Es, J. H., Schuijers, J., de Wit, E., de Laat, W., Hannon, G. J., Clevers, H. C., Smith, A. D. & Ketting, R. F., 2013, In: Genome Biology. 14, 5, blz. 50

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

97 Citaten (Scopus)

eRNAs are required for p53-dependent enhancer activity and gene transcription

Melo, C. A., Drost, J., Wijchers, P. J., van de Werken, H., de Wit, E., Oude Vrielink, J. A., Elkon, R., Melo, S. A., Leveille, N., Kalluri, R., de Laat, W. & Agami, R., 2013, In: Molecular Cell. 49, 3, blz. 524-535

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

451 Citaten (Scopus)

Flexible long-range loops in the VH gene region of the Igh locus facilitate the generation of a diverse antibody repertoire

Medvedovic, J., Ebert, A., Tagoh, H., Tamir, I. M., Schwickert, T. A., Novatchkova, M., Sun, Q., Huis In 't Veld, P. J., Guo, C., Yoon, H. S., Denizot, Y., Holwerda, S. J., de Laat, W., Cogne, M., Shi, Y., Alt, F. W. & Busslinger, M., 2013, In: Immunity. 39, 2, blz. 229-244

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

121 Citaten (Scopus)

For genomes to stay in shape, insulators must be up to PAR

Wijchers, P. J. & de Laat, W., 2013, In: Cell. 155, 1, blz. 15-16

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Genome-wide analysis of FOXO3 mediated transcription regulation through RNA polymerase II profiling

Eijkelenboom, A., Mokry, M., de Wit, E., Smits, L. M., Polderman, P. E., van Triest, M. H., van Boxtel, R., Schulze, A., de Laat, W., Cuppen, E. & Burgering, B. M., 2013, In: Molecular Systems Biology. 9, blz. 638

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

103 Citaten (Scopus)

Identical cells with different 3D genomes; cause and consequences?

Krijger, P. H. & de Laat, W., 2013, In: Current Opinion in Genetics & Development. 23, 2, blz. 191-196

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

39 Citaten (Scopus)

Long-range chromatin contacts in embryonic stem cells reveal a role for pluripotency factors and polycomb proteins in genome organization

Denholtz, M., Bonora, G., Chronis, C., Splinter, E., de Laat, W., Ernst, J., Pellegrini, M. & Plath, K., 2013, In: Cell Stem Cell. 13, 5, blz. 602-616

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

228 Citaten (Scopus)

The pluripotent genome in three dimensions is shaped around pluripotency factors

de Wit, E., Bouwman, B. A. M., Zhu, Y., Klous, P., Splinter, E., Verstegen, M. J., Krijger, P. H., Festuccia, N., Nora, E. P., Welling, M., Heard, E., Geijsen, N., Poot, R. A., Chambers, I. & de Laat, W., 2013, In: Nature. 501, 7466, blz. 227-231

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

220 Citaten (Scopus)

Topology of mammalian developmental enhancers and their regulatory landscapes

de Laat, W. & Duboule, D., 2013, In: Nature. 502, 7472, blz. 499-506

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

393 Citaten (Scopus)

X zonder kruisvorm

de Laat, W., 08 nov. 2013, In: C2W. blz. 26

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

2012

3C-based technologies to study the shape of the genome

de Laat, W. & Dekker, J., 2012, In: Methods. 58, 3, blz. 189-191

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

70 Citaten (Scopus)

3D chromatin conformation correlates with replication timing and is conserved in resting cells

Moindrot, B., Audit, B., Klous, P., Baker, A., Thermes, C., de Laat, W., Bouvet, P., Mongelard, F. & Arneodo, A., 2012, In: Nucleic Acids Research. 40, 19, blz. 9470-9481

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

67 Citaten (Scopus)

4C technology: protocols and data analysis

van de Werken, H. J., de Vree, P. J., Splinter, E., Holwerda, S. J., Klous, P., de Wit, E. & de Laat, W., 2012, In: Methods in Enzymology. 513, blz. 89-112

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

181 Citaten (Scopus)

A decade of 3C technologies: insights into nuclear organization

de Wit, E. & de Laat, W., 2012, In: Genes & Development. 26, 1, blz. 11-24

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

576 Citaten (Scopus)

Chromatin loops, gene positioning, and gene expression

Holwerda, S. & de Laat, W., 2012, In: Frontiers in Genetics. 3, blz. 217

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

72 Citaten (Scopus)

Determining long-range chromatin interactions for selected genomic sites using 4C-seq technology: From fixation to computation

Splinter, E., de Wit, E., van de Werken, H. J., Klous, P. & de Laat, W., 2012, In: Methods. 58, 3, blz. 221-230

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

180 Citaten (Scopus)

Farmabedrijf-claimt-succes-in-dna-analyse

de Laat, W., 2012, In: Het Financieele Dagblad.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

Geknipt Sequensen

de Laat, W., 06 okt. 2012, In: C2W. blz. 26-27

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

Robust 4C-seq data analysis to screen for regulatory DNA interactions

van de Werken, H. J., Landan, G., Holwerda, S. J., Hoichman, M., Klous, P., Chachik, R., Splinter, E., Valdes-Quezada, C., Oz, Y., Bouwman, B. A., Verstegen, M. J., de Wit, E., Tanay, A. & de Laat, W., 2012, In: Nature Methods. 9, 10, blz. 969-972

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

308 Citaten (Scopus)

The Dynamic Architecture of Hox Gene Clusters

Noordermeer, D., Leleu, M., Splinter, E., Rougemont, J., de Laat, W. & Duboule, D., 2012, In: Science Magazine. 334, 6053, blz. 222-225 5 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

316 Citaten (Scopus)

2011

Al je genen op een dvd

de Laat, W. & Benedictus, R., 2011, In: Uniek. blz. 20-21

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Populair

An evolutionarily conserved three-dimensional structure in the vertebrate Irx clusters facilitates enhancer sharing and coregulation

Tena, J. J., Alonso, M. E., de la Calle-Mustienes, E., Splinter, E., de Laat, W., Manzanares, M. & Gomez-Skarmeta, J. L., 2011, In: Nature Communications. 2, blz. 310

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

62 Citaten (Scopus)

A regulatory archipelago controls hox genes transcription in digits

Montavon, T., Soshnikova, N., Mascrez, B., Joye, E., Thevenet, L., Splinter, E., de Laat, W., Spitz, F. & Duboule, D., 2011, In: Cell. 147, 5, blz. 1132-1145

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

395 Citaten (Scopus)

Diverse gene reprogramming events occur in the same spatial clusters of distal regulatory elements

Hakim, O., Sung, M. H., Voss, T. C., Splinter, E., John, S., Sabo, P. J., Thurman, R. E., Stamatoyannopoulos, J. A., de Laat, W. & Hager, G. L., 2011, In: Genome Research. 21, 5, blz. 697-706

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

118 Citaten (Scopus)

Genomics: Genomes in three dimensions

Baker, M. & de Laat, W., 2011, In: Nature. 470, 7333, blz. 289-294

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Professioneel

19 Citaten (Scopus)

Integrated transcript and genome analyses reveal NKX2-1 and MEF2C as potential oncogenes in T cell acute lymphoblastic leukemia

Homminga, I., Pieters, R., Langerak, A. W., de Rooi, J. J., Stubbs, A., Verstegen, M., Vuerhard, M., Buijs-Gladdines, J., Kooi, C., Klous, P., van Vlierberghe, P., Ferrando, A. A., Cayuela, J. M., Verhaaf, B., Beverloo, H. B., Horstmann, M., de Haas, V., Wiekmeijer, A. S., Pike-Overzet, K., Staal, F. J., & 4 anderende Laat, W., Soulier, J., Sigaux, F. & Meijerink, J. P., 2011, In: Cancer Cell. 19, 4, blz. 484-497

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

318 Citaten (Scopus)

Interactions among Polycomb Domains Are Guided by Chromosome Architecture

Tolhuis, B., Blom, M., Kerkhoven, R. M., Pagie, L., Teunissen, H., Nieuwland, M., Simonis, M., de Laat, W., van Lohuizen, M. & van Steensel, B., 2011, In: PLoS Genetics. 7, 3, blz. 1001343

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

Open Access

Bestand

147 Citaten (Scopus)

322 Downloads (Pure)

The complex transcription regulatory landscape of our genome: control in three dimensions

Splinter, E. & de Laat, W., 2011, In: EMBO Journal. 30, 21, blz. 4345-4355

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

60 Citaten (Scopus)

The inactive X chromosome adopts a unique three-dimensional conformation that is dependent on Xist RNA

Splinter, E., de Wit, E., Nora, E. P., Klous, P., van de Werken, H., Zhu, Y., Kaaij, L. J., van Ijcken, W., Gribnau, J., Heard, E. & de Laat, W., 2011, In: Genes & Development. 25, 13, blz. 1371-1383

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

259 Citaten (Scopus)

Variegated gene expression caused by cell-specific long-range DNA interactions

Noordermeer, D., de Wit, E., Klous, P., van de Werken, H., Simonis, M., Lopez-Jones, M., Eussen, B., Klein, A. M., Singer, R. H. & de Laat, W., 2011, In: Nature Cell Biology. 13, 8, blz. 944-951

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

132 Citaten (Scopus)

2010

Genome organization influences partner selection for chromosomal rearrangements

Wijchers, P. J. & de Laat, W., 2010, In: Trends in Genetics. 27, 2, blz. 63-71

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

40 Citaten (Scopus)

Spin-off uit vouwend DNA

de Laat, W., 2010, In: Onderzoekers verbreden de Horizon.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk

2009

High-resolution identification of balanced and complex chromosomal rearrangements by 4C technology.

Simonis, M., Klous, P., Homminga, I., Galjaard, R. J., Rijkers, E. J., Grosveld, F., Meijerink, J. P. & de Laat, W., 2009, In: Nature Methods. 6, 11, blz. 837-842

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

82 Citaten (Scopus)

Studying physical chromatin interactions in plants using Chromosome Conformation Capture (3C).

Louwers, M., Splinter, E., van Driel, R., de Laat, W. & Stam, M., 2009, In: Nature Protocols. 4, 8, blz. 1216-1229

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

84 Citaten (Scopus)

Tissue- and expression level-specific chromatin looping at maize b1 epialleles.

Louwers, M., Bader, R., Haring, M., van Driel, R., de Laat, W. & Stam, M., 2009, In: Plant Cell. 21, 3, blz. 832-842

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan wetenschappelijk tijdschrift/periodieke uitgave › Artikel › Wetenschappelijk › peer review

121 Citaten (Scopus)

Wouter de Laat

Onderzoeksoutput

Zoekresultaten